99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3135 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  53.54 
 
 		 104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  55.1 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  55.79 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  49.5 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  46.46 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  52.17 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  49.47 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  52.17 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  41.12 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  43.93 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  46.39 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  45.36 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  58.67 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  48.45 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  44.33 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  41.12 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  45.26 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  40.62 
 
 		 270 aa  80.9  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  43 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  44 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  38.68 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  43.02 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  33.67 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  36.27 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  34.78 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  60 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  31.58 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  34.91 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  34.41 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  37.88 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  36.11 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  43.86 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  43.1 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  38.98 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  31.51 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  31.91 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  26.87 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  31.07 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  62.5 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  32.47 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  29.63 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  34.83 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  31.94 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  29.63 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  35.62 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  32.88 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  35.59 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  36.54 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.12 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.82 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  57.14 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  53.33 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  32.05 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  40.32 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  35.82 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  28.75 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1114  nucleotidyltransferases-like  45.65 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  47.37 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  37.1 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  30.86 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  32.88 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  35.82 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  27.16 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  34.85 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  30.34 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  29.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0365  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.200117 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  37.7 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  31.94 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  34.15 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  30.77 
 
 		 101 aa  40  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 100 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>