More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2533 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  69.52 
 
 		 187 aa  278  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  66.84 
 
 		 187 aa  260  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  64.71 
 
 		 187 aa  259  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  63.64 
 
 		 192 aa  253  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  63.98 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  63.98 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  62.03 
 
 		 187 aa  248  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  57.61 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  55.74 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  52.46 
 
 		 201 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  53.55 
 
 		 201 aa  201  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  53.76 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  52.22 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  53.59 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  49.72 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  49.72 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  49.17 
 
 		 202 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  44.31 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  43.71 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  42.51 
 
 		 171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  41.88 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  41.88 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  43.37 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  50.37 
 
 		 178 aa  131  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  44 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  45.27 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  45.68 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  43.33 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  43.05 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  42.53 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  47.41 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  43.48 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  43.71 
 
 		 171 aa  124  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  43.71 
 
 		 171 aa  124  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  47.14 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  40.25 
 
 		 180 aa  124  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  44.22 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  44.22 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  43.36 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  42 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  45.03 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  44.44 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  42.35 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  45.21 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  42 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.59 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  40.71 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  41.33 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  44 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  39.07 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  41.5 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  36.94 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  47.14 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  47.14 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  42.47 
 
 		 153 aa  121  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  43.71 
 
 		 171 aa  121  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  41.38 
 
 		 179 aa  121  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  40.82 
 
 		 183 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  42.76 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40.67 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40.67 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  36.94 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  46.43 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  46.43 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  46.43 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  46.43 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  47.97 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  41.72 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  45.71 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  46.21 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  40.54 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  42.38 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  44.76 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  40.13 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  46.1 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  42.65 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  38.46 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  45.71 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  38.93 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  45.77 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  42.67 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  44.68 
 
 		 150 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  52.54 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  45.52 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  43.57 
 
 		 157 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  44.76 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  43.84 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  38.65 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  43.42 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  42.28 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  37.43 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  40.67 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  40.99 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  40.79 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  42.65 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  40.79 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  40.41 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  44.93 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>