More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0605 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  100 
 
 		 370 aa  747    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  37.9 
 
 		 424 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  50.93 
 
 		 235 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  37.33 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  28.53 
 
 		 536 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  38.97 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  28.05 
 
 		 532 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  32.18 
 
 		 578 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  31.9 
 
 		 582 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  30.9 
 
 		 577 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  30.72 
 
 		 582 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  30.92 
 
 		 582 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  31.09 
 
 		 579 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  30.79 
 
 		 575 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  47.86 
 
 		 265 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.79 
 
 		 580 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  27.2 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  30.77 
 
 		 341 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  42.51 
 
 		 255 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.06 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  29.49 
 
 		 598 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  30.17 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  30.17 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 216 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  45.65 
 
 		 181 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  30.17 
 
 		 420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  30.17 
 
 		 420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.75 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  48.2 
 
 		 178 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  29.89 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  30.39 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  30.57 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.8 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  26.67 
 
 		 556 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  48.78 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  29.51 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  47.58 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  47.58 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.56 
 
 		 183 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 150 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.17 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.26 
 
 		 232 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  47.55 
 
 		 476 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  55.66 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  34.12 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  40 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  41.03 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  41.03 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  40 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  41.03 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  41.77 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  47.46 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  41.03 
 
 		 218 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  41.03 
 
 		 218 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  41.03 
 
 		 218 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  41.03 
 
 		 218 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 223 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  42.76 
 
 		 208 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 215 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 215 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  48.33 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  44.62 
 
 		 224 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  41.77 
 
 		 224 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  43.17 
 
 		 188 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 274 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  38.89 
 
 		 225 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  43.09 
 
 		 226 aa  106  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40.51 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  42.75 
 
 		 222 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  43.65 
 
 		 170 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40.51 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  43.65 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  39.71 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  43.9 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  37.76 
 
 		 273 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 246 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  38.32 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  51.06 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  32.8 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  42.42 
 
 		 234 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  32.8 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  32.8 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  32.28 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 188 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  32.8 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.04 
 
 		 217 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  31.77 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  32.8 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  41.33 
 
 		 173 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 234 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>