More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4062 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 425 aa  841    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  69.83 
 
 		 423 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  43.5 
 
 		 533 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  42.55 
 
 		 533 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  38.82 
 
 		 531 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  41.65 
 
 		 534 aa  283  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  40.51 
 
 		 524 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  37.89 
 
 		 537 aa  263  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  36.98 
 
 		 525 aa  260  4e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  35.34 
 
 		 527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  35.66 
 
 		 524 aa  249  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  36.54 
 
 		 524 aa  249  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  36.61 
 
 		 527 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  37.72 
 
 		 533 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  37.32 
 
 		 531 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  35.11 
 
 		 537 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  38.64 
 
 		 524 aa  228  1e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  36.54 
 
 		 535 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  36.84 
 
 		 537 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  37.59 
 
 		 531 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  33.89 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  34.27 
 
 		 528 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  35.61 
 
 		 532 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  35.1 
 
 		 536 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  35.38 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  36.71 
 
 		 535 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  35.61 
 
 		 550 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  35.42 
 
 		 553 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  35.71 
 
 		 534 aa  212  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  34.12 
 
 		 527 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  35.15 
 
 		 537 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  37.34 
 
 		 539 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  36.75 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  34.67 
 
 		 548 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  34.43 
 
 		 548 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  36.08 
 
 		 550 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  34.76 
 
 		 624 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  33.97 
 
 		 555 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  34.8 
 
 		 526 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  33.18 
 
 		 548 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.79 
 
 		 551 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  33.18 
 
 		 563 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  35.47 
 
 		 555 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  34.61 
 
 		 555 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  33.18 
 
 		 563 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  34.37 
 
 		 526 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  33.18 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  33.18 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  35.47 
 
 		 555 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  35.47 
 
 		 555 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  35.47 
 
 		 633 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  35.51 
 
 		 533 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  35.77 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  32.1 
 
 		 551 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.03 
 
 		 528 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  35.84 
 
 		 523 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  34.01 
 
 		 566 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  33.81 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 538 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  34.24 
 
 		 556 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  32.32 
 
 		 524 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  33.18 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  33.94 
 
 		 548 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 577 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  34.27 
 
 		 548 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  35.02 
 
 		 527 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  35.02 
 
 		 527 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  34.92 
 
 		 624 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 		 554 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  32.63 
 
 		 654 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  34.83 
 
 		 523 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  34.05 
 
 		 527 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  32.8 
 
 		 549 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  34.05 
 
 		 527 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  34.05 
 
 		 527 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  33.98 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  33.98 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  33.98 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  33.98 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  33.98 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  33.98 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  33.98 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  33.98 
 
 		 549 aa  186  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  37.15 
 
 		 533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  37.4 
 
 		 533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  37.15 
 
 		 533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 829 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  34.2 
 
 		 527 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 525 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 		 521 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  34.34 
 
 		 621 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  33.6 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>