More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0019 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 570 aa  1165    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  81.93 
 
 		 562 aa  927    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  82.87 
 
 		 570 aa  946    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  78.69 
 
 		 568 aa  911    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  82.14 
 
 		 566 aa  897    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  82.63 
 
 		 551 aa  916    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  82.06 
 
 		 565 aa  937    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  37.63 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  39.15 
 
 		 535 aa  360  5e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  38.4 
 
 		 504 aa  353  5e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  37.73 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  35.64 
 
 		 543 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  45.19 
 
 		 604 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  37.31 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  42.57 
 
 		 520 aa  321  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  41.96 
 
 		 516 aa  317  5e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  41.56 
 
 		 520 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  37.69 
 
 		 530 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  33.91 
 
 		 543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  36.5 
 
 		 496 aa  301  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  36.08 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  36.31 
 
 		 496 aa  297  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  36.42 
 
 		 531 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  35.53 
 
 		 503 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  33.27 
 
 		 515 aa  295  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  33.21 
 
 		 496 aa  293  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  33.21 
 
 		 496 aa  293  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  31.03 
 
 		 512 aa  292  9e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  39.14 
 
 		 516 aa  289  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  36.29 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  36.31 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  37.72 
 
 		 514 aa  282  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  31.3 
 
 		 525 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  37.22 
 
 		 1031 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  31.9 
 
 		 559 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  35.15 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  33.59 
 
 		 562 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  39.18 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  35.08 
 
 		 919 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  35.34 
 
 		 903 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1711  ribonuclease E  32.58 
 
 		 868 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  34.73 
 
 		 792 aa  264  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0738  ribonuclease  37.21 
 
 		 740 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  32.22 
 
 		 636 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0732  ribonuclease, Rne/Rng family  38.37 
 
 		 844 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0731  ribonuclease, Rne/Rng family  38.37 
 
 		 860 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.767786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  35.49 
 
 		 806 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  32.3 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1776  ribonuclease E  31.08 
 
 		 984 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000943072  decreased coverage  0.00020345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  32.26 
 
 		 537 aa  261  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  33.91 
 
 		 497 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  40.3 
 
 		 702 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  34.24 
 
 		 808 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2728  ribonuclease, Rne/Rng family  38.05 
 
 		 1053 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  32.71 
 
 		 564 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  32.4 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0696  ribonuclease G  37.35 
 
 		 868 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6047  ribonuclease, Rne/Rng family  38.32 
 
 		 1045 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  32 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0393  ribonuclease  38.62 
 
 		 1092 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3009  ribonuclease  38.64 
 
 		 1060 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00611074  normal  0.333184 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  36.3 
 
 		 499 aa  258  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2318  ribonuclease E  31.72 
 
 		 935 aa  256  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2149  RNAse E  30.59 
 
 		 889 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  39.1 
 
 		 990 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2854  ribonuclease  38.64 
 
 		 1029 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.541303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0388  ribonuclease  31.46 
 
 		 906 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  39.05 
 
 		 1175 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  33.07 
 
 		 489 aa  253  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  33.07 
 
 		 489 aa  253  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  33.07 
 
 		 489 aa  253  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1353  ribonuclease E  31.63 
 
 		 938 aa  253  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000765938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3278  ribonuclease  31.49 
 
 		 863 aa  253  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.027998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  40.06 
 
 		 1007 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  39.4 
 
 		 908 aa  252  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  33.08 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  32.33 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  33.4 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  32.68 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3659  ribonuclease  37.13 
 
 		 1049 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3952  ribonuclease, Rne/Rng family  37.13 
 
 		 1046 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0825957  normal  0.60191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4204  ribonuclease E  37.76 
 
 		 1070 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  40.54 
 
 		 1194 aa  251  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  41.19 
 
 		 1265 aa  251  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  36.62 
 
 		 492 aa  250  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2442  ribonuclease  37.46 
 
 		 1043 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  30.5 
 
 		 457 aa  250  6e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4668  ribonuclease  37.29 
 
 		 1080 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.156996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  33.01 
 
 		 489 aa  249  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3946  ribonuclease, Rne/Rng family  36.83 
 
 		 1065 aa  249  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.213913 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0908  ribonuclease Rne/Rng domain-containing protein  36.36 
 
 		 891 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000577362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  40.71 
 
 		 1117 aa  248  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  37.92 
 
 		 496 aa  247  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4649  ribonuclease  36.76 
 
 		 1043 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332201 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  32.1 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  32.1 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  32.1 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  39.04 
 
 		 1427 aa  247  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  32.3 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  32.1 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>