More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0696 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0732  ribonuclease, Rne/Rng family  87.08 
 
 
844 aa  1033    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0696  ribonuclease G  100 
 
 
868 aa  1705    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0731  ribonuclease, Rne/Rng family  88.16 
 
 
860 aa  1080    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.767786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0738  ribonuclease  76.87 
 
 
740 aa  989    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  60.15 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  56.14 
 
 
503 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  59.9 
 
 
496 aa  465  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  59.39 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  58.88 
 
 
531 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  58.11 
 
 
500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  58.7 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  57.61 
 
 
530 aa  449  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  59.39 
 
 
507 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  49.27 
 
 
543 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  49.87 
 
 
1031 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  52.28 
 
 
517 aa  399  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  48.54 
 
 
564 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  48.74 
 
 
559 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  47.5 
 
 
496 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  46.21 
 
 
492 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  47.5 
 
 
496 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  47.23 
 
 
494 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  48.48 
 
 
492 aa  362  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  46.4 
 
 
489 aa  358  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  48.01 
 
 
485 aa  353  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  47.76 
 
 
485 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  44.58 
 
 
489 aa  352  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  45.66 
 
 
489 aa  350  6e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  48.88 
 
 
485 aa  350  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  46.42 
 
 
490 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  45.66 
 
 
489 aa  348  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  44.58 
 
 
489 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  44.58 
 
 
489 aa  348  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  48.5 
 
 
493 aa  346  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0424  ribonuclease  44.83 
 
 
613 aa  344  4e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319461  hitchhiker  0.0000523275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  45.54 
 
 
489 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  45.54 
 
 
489 aa  343  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  45.54 
 
 
489 aa  343  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  45.54 
 
 
489 aa  343  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  45.54 
 
 
489 aa  343  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  45.54 
 
 
489 aa  343  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  45.54 
 
 
489 aa  343  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  47.86 
 
 
493 aa  344  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  45.54 
 
 
489 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  43.07 
 
 
562 aa  343  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  43.95 
 
 
483 aa  343  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  48.64 
 
 
485 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  48.15 
 
 
487 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  43.97 
 
 
487 aa  340  9e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  46.77 
 
 
492 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  48.64 
 
 
485 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  49 
 
 
504 aa  339  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  44.8 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  45.05 
 
 
528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  47.44 
 
 
571 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  44.8 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  44.8 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  44.8 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  44.8 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  48.64 
 
 
485 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  45.05 
 
 
528 aa  337  5.999999999999999e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  46.87 
 
 
485 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  44.22 
 
 
488 aa  336  9e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  48.15 
 
 
485 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  44.22 
 
 
497 aa  335  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  44.19 
 
 
497 aa  335  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  44.19 
 
 
497 aa  334  4e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  46.77 
 
 
485 aa  334  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  44.31 
 
 
489 aa  334  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  46.77 
 
 
485 aa  333  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  48.84 
 
 
1194 aa  332  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  44.31 
 
 
489 aa  331  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  46.35 
 
 
490 aa  331  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  47.01 
 
 
1427 aa  331  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  44.31 
 
 
489 aa  330  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  46.35 
 
 
495 aa  330  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  44.76 
 
 
491 aa  328  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  44.85 
 
 
491 aa  328  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  44.44 
 
 
491 aa  327  5e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  43.56 
 
 
489 aa  327  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  43.56 
 
 
489 aa  327  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  43.56 
 
 
489 aa  327  6e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  44.69 
 
 
496 aa  327  6e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  44.95 
 
 
490 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0379  ribonuclease G  47.36 
 
 
484 aa  327  9e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  44.96 
 
 
483 aa  326  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1377  ribonuclease G  45.34 
 
 
488 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1233  ribonuclease  45.34 
 
 
488 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1008  ribonuclease G  45.34 
 
 
508 aa  326  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1224  ribonuclease  45.34 
 
 
488 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2218  ribonuclease  44.7 
 
 
489 aa  326  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.513685  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2339  ribonuclease  44.7 
 
 
489 aa  326  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0414308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  44.64 
 
 
515 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  44.7 
 
 
489 aa  325  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  44.7 
 
 
489 aa  325  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  43.32 
 
 
489 aa  325  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  44.7 
 
 
489 aa  325  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  44.7 
 
 
489 aa  325  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  45.16 
 
 
489 aa  325  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1891  ribonuclease G  45.09 
 
 
488 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>