More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1066 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 382 aa  785    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  72.53 
 
 		 389 aa  566  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  62.57 
 
 		 385 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  38.53 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  33.14 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  30.94 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  30.19 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  32.17 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 374 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  32.63 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.42 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  30.84 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  32.33 
 
 		 384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 		 370 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  31.42 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  30.15 
 
 		 431 aa  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.82 
 
 		 398 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 434 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30.45 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  27.34 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 		 373 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  26.8 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  29.06 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  31.6 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  25.13 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.88 
 
 		 435 aa  99.8  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  25.13 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 390 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.06 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  30.46 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.06 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  25.06 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.19 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  29.28 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 418 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 		 443 aa  92.8  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 426 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  31.1 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  30.65 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  30.04 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 438 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  31.21 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.9 
 
 		 468 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.06 
 
 		 449 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  26.02 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  26.5 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  26.72 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  26.5 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 		 365 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 438 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.28 
 
 		 431 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 407 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>