290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0788 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  100 
 
 		 317 aa  642    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  39.12 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  34.29 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  35.03 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  34.63 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0057  putative mRNA 3'-end processing factor  30.82 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0060  putative mRNA 3'-end processing factor  29.85 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0072  putative mRNA 3'-end processing factor  29.85 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0055  putative mRNA 3'-end processing factor  30.15 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0621  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1113  hypothetical protein  27.44 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.704257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  25.93 
 
 		 347 aa  89  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.82 
 
 		 1017 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3523  RNA procession exonuclease  25.46 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  26.69 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  27.04 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  24.2 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  28.04 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4896  putative mRNA 3-end processing factor  26.51 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  22.12 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  27.02 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  26.56 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  25.31 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  27.71 
 
 		 371 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  25.61 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1852  putative mRNA 3-end processing factor  29.3 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.681251  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  22.59 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  24.84 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  22.29 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1612  RNA procession exonuclease-like protein  23.36 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  23.35 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  24.83 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  23.68 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3896  hypothetical protein  22.54 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  25.16 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  30.21 
 
 		 793 aa  68.9  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  23.17 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  27.3 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  24.84 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1132  hypothetical protein  29.84 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00888  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  26.63 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  22.7 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  25.79 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  25.79 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 635 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 		 425 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  25.62 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  24.56 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2587  hypothetical protein  24.92 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136385 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  24.54 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  30.3 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  25.12 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 635 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.17 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 830 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  27.72 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  26.87 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.89 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  24.1 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  25.31 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  32.79 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  24.7 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  23.93 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.599734 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  23.78 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4681  putative exonuclease involved in mRNA processing  23.55 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  0.0823984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29.23 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2916  mRNA 3'-end processing factor  25.62 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  21.82 
 
 		 635 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3872  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  31.91 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  23.81 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  24.17 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  22.71 
 
 		 635 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  26.11 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4306  RNA procession exonuclease-like protein  24.39 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 635 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6008  hypothetical protein  23.12 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2308  hypothetical protein  26.6 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146289  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1314  putative exonuclease involved in mRNA processing  23.32 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0772701  normal  0.174474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  25.69 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 635 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02710  hypothetical protein  28.69 
 
 		 773 aa  60.1  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01738  mRNA 3'-end processing factor  23.81 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 642 aa  59.7  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>