More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0575 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  100 
 
 		 224 aa  427  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  66.18 
 
 		 215 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  68.32 
 
 		 210 aa  257  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  68 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  61.66 
 
 		 213 aa  218  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  54.59 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  56.72 
 
 		 901 aa  214  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  58.85 
 
 		 705 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  58.45 
 
 		 703 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  56.37 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  56.22 
 
 		 707 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  58.67 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  58.54 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  57.33 
 
 		 662 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 688 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  54.42 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  51.49 
 
 		 221 aa  201  9e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  50 
 
 		 671 aa  198  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  49.31 
 
 		 686 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  54.38 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  49.31 
 
 		 688 aa  187  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  53.73 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  54.15 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 686 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  53.96 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  50.68 
 
 		 707 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.25 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  46.83 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.39 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.88 
 
 		 207 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  46.08 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.28 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  46.48 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  48.94 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  49.3 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.08 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  49.3 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.78 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  50 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.8 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.41 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  50 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  43.28 
 
 		 205 aa  158  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  47.89 
 
 		 730 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  49.29 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  45.19 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  48.69 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  44.56 
 
 		 203 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  44.95 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  39.41 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  49.47 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  39.41 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.66 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  44.91 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  51.47 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  44 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.62 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  48.5 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.69 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  47.83 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 203 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.33 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  40.4 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  42.45 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 211 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  40.4 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>