209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0035 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  100 
 
 
231 aa  474  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  58.77 
 
 
233 aa  276  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  54.36 
 
 
234 aa  210  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  45.81 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  43.16 
 
 
239 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  47.47 
 
 
228 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  43.35 
 
 
234 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  43.67 
 
 
242 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  47.62 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  50.26 
 
 
225 aa  178  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.11 
 
 
259 aa  178  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.71 
 
 
253 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  40.71 
 
 
259 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.71 
 
 
259 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.3 
 
 
253 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  41.3 
 
 
253 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  41.3 
 
 
253 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.71 
 
 
259 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.3 
 
 
253 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  41.7 
 
 
253 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  69.64 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  43.78 
 
 
228 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  45.93 
 
 
224 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  39.34 
 
 
270 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  38.93 
 
 
267 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  37.71 
 
 
267 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  38.86 
 
 
229 aa  147  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  59.02 
 
 
310 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  56.14 
 
 
286 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  55.26 
 
 
546 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  53.38 
 
 
231 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  51.69 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  46.94 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  49.14 
 
 
242 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  54.95 
 
 
163 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  49.11 
 
 
241 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  53.98 
 
 
190 aa  118  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  42.95 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  47.86 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  48.25 
 
 
239 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  42.21 
 
 
208 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  49.11 
 
 
201 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  46.55 
 
 
216 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  45.69 
 
 
264 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  50.43 
 
 
203 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  38.89 
 
 
197 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  45 
 
 
194 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  37.87 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  37.87 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  37.87 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  44.35 
 
 
235 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  37.87 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  37.87 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  41.59 
 
 
200 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  40.71 
 
 
200 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  45.13 
 
 
277 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  42.4 
 
 
265 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  36.9 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  42.4 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  42.4 
 
 
265 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  36.69 
 
 
265 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  51.58 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  42.24 
 
 
265 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  44.83 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  39.34 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  38.52 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  42.61 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  29.61 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  39.37 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  39.67 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  35.04 
 
 
400 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  36.7 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  33.87 
 
 
466 aa  62  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  33.06 
 
 
429 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  33.87 
 
 
460 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  35.46 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  32.65 
 
 
488 aa  59.3  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  57.45 
 
 
402 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  57.45 
 
 
409 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  33.59 
 
 
496 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  33.87 
 
 
476 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  28.8 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  33.87 
 
 
429 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.64 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  45 
 
 
327 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  50.85 
 
 
391 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.14 
 
 
391 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  33.87 
 
 
476 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  31.78 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  32.06 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  39.56 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  42.86 
 
 
406 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  42.47 
 
 
240 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  42.47 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  52.08 
 
 
410 aa  55.1  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  30.53 
 
 
383 aa  55.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  45.21 
 
 
324 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  51.06 
 
 
377 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  53.19 
 
 
301 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  53.19 
 
 
301 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>