More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2027 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  100 
 
 		 333 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  71.65 
 
 		 325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.3 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  61.71 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.78 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.46 
 
 		 327 aa  374  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.94 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.44 
 
 		 328 aa  374  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.31 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.1 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.78 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.95 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.78 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.88 
 
 		 342 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  61.76 
 
 		 326 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.02 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  60.95 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  59.68 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  60.51 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  61.86 
 
 		 327 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  58.07 
 
 		 327 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  59.56 
 
 		 327 aa  361  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.94 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  60.9 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  59.94 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.59 
 
 		 322 aa  355  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  58.1 
 
 		 326 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  61.56 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  59.29 
 
 		 322 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  59.37 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  62.15 
 
 		 355 aa  348  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  60.57 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.39 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  60 
 
 		 327 aa  341  9e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.27 
 
 		 351 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.49 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.2 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  60.57 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.2 
 
 		 344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  62.06 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.04 
 
 		 325 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  61.27 
 
 		 349 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.62 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  60.7 
 
 		 354 aa  335  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  59.5 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.62 
 
 		 350 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  58.99 
 
 		 356 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.68 
 
 		 345 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  57.98 
 
 		 344 aa  331  8e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.68 
 
 		 353 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  57.79 
 
 		 327 aa  322  5e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  56 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.93 
 
 		 325 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  53.14 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  51.24 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  49.68 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  52.81 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  49.37 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  50.5 
 
 		 321 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  50.17 
 
 		 323 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.12 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  47.12 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  50.16 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  42.68 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  40.51 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.71 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  45.74 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  45.74 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.9 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.35 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.1 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  42.58 
 
 		 322 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  37.7 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.31 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  43.71 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  42.09 
 
 		 321 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  40.3 
 
 		 346 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  37.46 
 
 		 458 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  37.73 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  36.84 
 
 		 479 aa  175  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  36.42 
 
 		 569 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  37.38 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  37.7 
 
 		 589 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  37.95 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 464 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 468 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  36.51 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  36.81 
 
 		 466 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  37.17 
 
 		 455 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  37.29 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  36.48 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  40.26 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  35.69 
 
 		 572 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  35.95 
 
 		 451 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  36.63 
 
 		 454 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  39.67 
 
 		 474 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  39.6 
 
 		 469 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  36.72 
 
 		 412 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  37.05 
 
 		 624 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  39.14 
 
 		 469 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>