167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0408 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  100 
 
 
891 aa  1792    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  50.93 
 
 
801 aa  518  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  50.26 
 
 
803 aa  518  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  43.21 
 
 
602 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  42.33 
 
 
604 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  37.9 
 
 
534 aa  339  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  51.84 
 
 
576 aa  271  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  52.04 
 
 
769 aa  261  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  49.13 
 
 
792 aa  255  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  50.55 
 
 
773 aa  250  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  50.19 
 
 
758 aa  246  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  46.48 
 
 
717 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  50.92 
 
 
629 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  50.74 
 
 
289 aa  241  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  49.26 
 
 
618 aa  240  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  47.51 
 
 
710 aa  238  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  50.7 
 
 
709 aa  238  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  49.63 
 
 
289 aa  237  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  49.81 
 
 
760 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  46.26 
 
 
620 aa  226  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  38.77 
 
 
510 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  30.43 
 
 
444 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  31.39 
 
 
596 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  31.05 
 
 
444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  31.23 
 
 
442 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  32.64 
 
 
1276 aa  129  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  30.06 
 
 
584 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  30.88 
 
 
442 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 
437 aa  121  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  27.08 
 
 
437 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  28.45 
 
 
1141 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  31.17 
 
 
873 aa  114  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  31.65 
 
 
562 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  29.45 
 
 
340 aa  107  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  28.13 
 
 
614 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  30.37 
 
 
554 aa  101  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  31.8 
 
 
392 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  28.57 
 
 
662 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  30.14 
 
 
564 aa  99  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  31.37 
 
 
398 aa  95.9  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  24.85 
 
 
605 aa  94.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  28.01 
 
 
596 aa  94  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  31.45 
 
 
380 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  32.75 
 
 
415 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  27.27 
 
 
654 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  27.84 
 
 
597 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  29.84 
 
 
450 aa  88.2  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  29.84 
 
 
450 aa  88.2  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  29.84 
 
 
450 aa  88.2  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  28.76 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  31.14 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  33.05 
 
 
372 aa  82.8  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  25.08 
 
 
600 aa  82  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  27.68 
 
 
1086 aa  80.9  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  26.69 
 
 
442 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  26.69 
 
 
442 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  26.69 
 
 
442 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  26.69 
 
 
442 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  26.69 
 
 
442 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  26.69 
 
 
442 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  26.69 
 
 
442 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  26.34 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  27.87 
 
 
446 aa  77.4  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  27.06 
 
 
450 aa  77  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  25.95 
 
 
586 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  25.49 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  26.21 
 
 
1025 aa  75.1  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  28.19 
 
 
601 aa  75.1  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  26.3 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  24.52 
 
 
447 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  26.79 
 
 
558 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  27.85 
 
 
601 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  23.69 
 
 
453 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  23.89 
 
 
544 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  24.37 
 
 
510 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  24.37 
 
 
510 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  24.37 
 
 
510 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  26.25 
 
 
468 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  24.44 
 
 
450 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  24.11 
 
 
510 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  24.11 
 
 
510 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  24.35 
 
 
452 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  24.38 
 
 
461 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  21.24 
 
 
550 aa  62  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  23.54 
 
 
476 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  22.62 
 
 
434 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3404  hypothetical protein  29.58 
 
 
457 aa  59.3  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.386077  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  27.23 
 
 
508 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  25.34 
 
 
481 aa  58.9  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  26.87 
 
 
500 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  26.76 
 
 
780 aa  54.3  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  24.92 
 
 
448 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1456  glycoside hydrolase family 1  26.97 
 
 
430 aa  52.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3901  glycoside hydrolase family 1  27.5 
 
 
479 aa  52.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00796853  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  22.95 
 
 
418 aa  52  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  21.75 
 
 
550 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3567  glycoside hydrolase family 1  27.93 
 
 
478 aa  51.6  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  26.99 
 
 
307 aa  51.6  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  34.91 
 
 
431 aa  51.2  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>