More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1989 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  82.73 
 
 		 565 aa  954    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  81.23 
 
 		 551 aa  907    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  84.99 
 
 		 566 aa  942    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  83.36 
 
 		 570 aa  954    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  100 
 
 		 568 aa  1161    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  80.56 
 
 		 570 aa  884    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  87.35 
 
 		 562 aa  991    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  39.37 
 
 		 604 aa  389  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  37.75 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  39.85 
 
 		 535 aa  365  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  38.27 
 
 		 516 aa  364  3e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  38.56 
 
 		 504 aa  358  1.9999999999999998e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  37.14 
 
 		 520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  38.63 
 
 		 516 aa  347  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  35.99 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  35.91 
 
 		 543 aa  335  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  36.35 
 
 		 503 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  34.82 
 
 		 543 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  38.78 
 
 		 530 aa  306  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  36.65 
 
 		 496 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  36.77 
 
 		 496 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  33.92 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  34.17 
 
 		 496 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  35.67 
 
 		 503 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  34.17 
 
 		 496 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  36.5 
 
 		 531 aa  299  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  31.31 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  33.63 
 
 		 515 aa  297  4e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  36.28 
 
 		 517 aa  296  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  31.64 
 
 		 512 aa  295  1e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  37.23 
 
 		 503 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  33.27 
 
 		 562 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  37.59 
 
 		 514 aa  282  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  37.97 
 
 		 1031 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  32.93 
 
 		 559 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1776  ribonuclease E  31.52 
 
 		 984 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000943072  decreased coverage  0.00020345 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  37.94 
 
 		 516 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  35.62 
 
 		 500 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  36.73 
 
 		 507 aa  277  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  35.16 
 
 		 537 aa  277  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  35.31 
 
 		 497 aa  277  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  37.66 
 
 		 499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  34.75 
 
 		 492 aa  273  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  34.5 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  33.59 
 
 		 497 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2131  RNAse E  30.59 
 
 		 936 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  35.01 
 
 		 792 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0806  ribonuclease  30.59 
 
 		 890 aa  270  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0942815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1711  ribonuclease E  32.33 
 
 		 868 aa  269  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  32.32 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2149  RNAse E  32.44 
 
 		 889 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0716  ribonuclease  30.78 
 
 		 869 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.695847 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  33.4 
 
 		 528 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  35.19 
 
 		 919 aa  266  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  32.01 
 
 		 564 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  32.77 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  35.06 
 
 		 903 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  32.8 
 
 		 528 aa  264  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  32.75 
 
 		 501 aa  264  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  40.8 
 
 		 702 aa  263  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  33.96 
 
 		 808 aa  263  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  34.21 
 
 		 493 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  32.77 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  31.63 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  33.27 
 
 		 489 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  32.89 
 
 		 489 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  32.01 
 
 		 488 aa  259  9e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  33.4 
 
 		 500 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2728  ribonuclease, Rne/Rng family  38.74 
 
 		 1053 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  31.8 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0732  ribonuclease, Rne/Rng family  37.69 
 
 		 844 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0589  ribonuclease, Rne/Rng family  31.04 
 
 		 1009 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000676969 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0731  ribonuclease, Rne/Rng family  37.69 
 
 		 860 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.767786  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1296  ribonuclease E  31.97 
 
 		 890 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.17459  normal  0.956429 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  32.64 
 
 		 491 aa  258  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  33.65 
 
 		 500 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3278  ribonuclease  32.54 
 
 		 863 aa  256  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.027998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6047  ribonuclease, Rne/Rng family  38.41 
 
 		 1045 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0696  ribonuclease G  37.44 
 
 		 868 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3009  ribonuclease  39.04 
 
 		 1060 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00611074  normal  0.333184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0738  ribonuclease  35.58 
 
 		 740 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  37.57 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0908  ribonuclease Rne/Rng domain-containing protein  35.29 
 
 		 891 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000577362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  32.65 
 
 		 502 aa  253  6e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4204  ribonuclease E  39.27 
 
 		 1070 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2854  ribonuclease  39.04 
 
 		 1029 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.541303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3946  ribonuclease, Rne/Rng family  36.34 
 
 		 1065 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.213913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  31.05 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  32.89 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  35.43 
 
 		 1102 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3659  ribonuclease  36.06 
 
 		 1049 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  33.08 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3952  ribonuclease, Rne/Rng family  36.06 
 
 		 1046 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0825957  normal  0.60191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  31.14 
 
 		 485 aa  251  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0912  ribonuclease Rne/Rng domain-containing protein  35.04 
 
 		 922 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00607829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0393  ribonuclease  37.8 
 
 		 1092 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4668  ribonuclease  38.87 
 
 		 1080 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.156996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0957  ribonuclease  37.87 
 
 		 944 aa  251  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545354  normal  0.0139882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1573  ribonuclease  35.68 
 
 		 1128 aa  250  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  32.94 
 
 		 502 aa  250  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>