More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8761 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  100 
 
 
385 aa  789    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  57.78 
 
 
381 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  47.14 
 
 
386 aa  342  7e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  46.35 
 
 
390 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  45.69 
 
 
394 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  44.96 
 
 
390 aa  322  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  46.27 
 
 
395 aa  312  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  43.23 
 
 
392 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  44.07 
 
 
390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  44.47 
 
 
389 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  44.8 
 
 
391 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  44.91 
 
 
385 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  45.43 
 
 
385 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  44.65 
 
 
385 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  44.65 
 
 
385 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  45.79 
 
 
389 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  45.19 
 
 
390 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  44.76 
 
 
388 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  45.57 
 
 
389 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  43.56 
 
 
389 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  43.34 
 
 
385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  41.22 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40 
 
 
387 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  38.82 
 
 
394 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.91 
 
 
387 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  38.05 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.26 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  38.18 
 
 
396 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  37.2 
 
 
383 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.89 
 
 
388 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.25 
 
 
389 aa  205  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  36.55 
 
 
381 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  37.87 
 
 
390 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  34.62 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  36.48 
 
 
393 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.55 
 
 
384 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  36.03 
 
 
453 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  33.17 
 
 
405 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.58 
 
 
397 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  35.11 
 
 
388 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  33.59 
 
 
386 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.85 
 
 
383 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  33.85 
 
 
385 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  39.07 
 
 
381 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.63 
 
 
388 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  35.96 
 
 
548 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  40.51 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  35.77 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.51 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  32.7 
 
 
395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  32.67 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  35.16 
 
 
393 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  35.53 
 
 
389 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  38.32 
 
 
381 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  42.57 
 
 
393 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.6 
 
 
385 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  37.13 
 
 
403 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.27 
 
 
360 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  38.07 
 
 
385 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  34.24 
 
 
548 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  35.79 
 
 
383 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  34.76 
 
 
389 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  36.46 
 
 
402 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  36.83 
 
 
383 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  36.19 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.23 
 
 
550 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.01 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  36.54 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.5 
 
 
550 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.5 
 
 
550 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  35.73 
 
 
390 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  33.97 
 
 
380 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.34 
 
 
388 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.34 
 
 
388 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  32.5 
 
 
541 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.07 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  33.42 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.07 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.07 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  31.81 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.07 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.07 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  33.85 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  35.56 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.81 
 
 
388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  34.57 
 
 
382 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  34.5 
 
 
379 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  35.87 
 
 
389 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37 
 
 
384 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.07 
 
 
388 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  34.53 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  32.79 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  32.88 
 
 
379 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.81 
 
 
383 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.08 
 
 
379 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.2 
 
 
386 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  33.97 
 
 
389 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  30.4 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.08 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  32.42 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>