More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0172 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  100 
 
 		 322 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  65.32 
 
 		 302 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  61.82 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  58.36 
 
 		 303 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  59.6 
 
 		 299 aa  335  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  58 
 
 		 302 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  63.42 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  53.77 
 
 		 322 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  53.99 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  53.9 
 
 		 330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  56.57 
 
 		 290 aa  301  9e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 323 aa  285  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  45.67 
 
 		 305 aa  248  7e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  54.38 
 
 		 256 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  41.81 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  46.53 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  46 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  55.25 
 
 		 237 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  48.01 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.15 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  46.81 
 
 		 254 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  45.15 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  45.15 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  49.31 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  45.39 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  46.85 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  46.62 
 
 		 301 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  45.82 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  45.18 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  48.14 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  48.54 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  44.15 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  44.15 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  44.15 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  43.96 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.6 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  50.45 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  49.55 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  40.59 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.67 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.7 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  42.13 
 
 		 256 aa  212  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  48.92 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  50 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  42.66 
 
 		 247 aa  208  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  43.48 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  43.55 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.99 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  50.69 
 
 		 276 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  41.39 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  40 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  43.71 
 
 		 329 aa  203  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  42.95 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  43.54 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 310 aa  202  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  43.9 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  38.85 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.98 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2064  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.68 
 
 		 335 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  35.18 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 		 327 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  46.38 
 
 		 334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.61 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  38.28 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  42.33 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  37.59 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  42.23 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.16 
 
 		 326 aa  195  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  50.72 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.03 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.17 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.83 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.9 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  47 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  41.81 
 
 		 741 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  37.59 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  42.16 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.99 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.18 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  38.08 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  45.15 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  40.74 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  45.66 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>