More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2161 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  99.31 
 
 		 291 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  58.84 
 
 		 297 aa  362  6e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  58.28 
 
 		 293 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  58.97 
 
 		 295 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  56.21 
 
 		 292 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  55.48 
 
 		 294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 290 aa  305  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  51.45 
 
 		 290 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 290 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 293 aa  278  5e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 291 aa  278  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 292 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 		 288 aa  266  4e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 289 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 292 aa  254  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  44.06 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  38.31 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  41.05 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  41.44 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  40.82 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 		 301 aa  248  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 		 301 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  41.97 
 
 		 301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  40.66 
 
 		 292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  42.55 
 
 		 290 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 291 aa  245  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  41.97 
 
 		 301 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 294 aa  244  9e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  41.72 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  39.31 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  41.16 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  40.56 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  42.55 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  41.84 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  41.5 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 296 aa  238  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  40.74 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>