More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09773 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  100 
 
 		 359 aa  731    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  64.07 
 
 		 359 aa  483  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  53.48 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  47.4 
 
 		 367 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  45.08 
 
 		 368 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  43.45 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  40.95 
 
 		 360 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  39.83 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  41.46 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  38.95 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.71 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.56 
 
 		 363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  32.35 
 
 		 369 aa  203  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  31.62 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.29 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  33.89 
 
 		 364 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.75 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  34.77 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  34.77 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  34.77 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  30.16 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.26 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  30.52 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  30.52 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  32.11 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  32.11 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  32.11 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  32.11 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  32.11 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  32.11 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  32.11 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  32.11 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  31.83 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  32.37 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  30.87 
 
 		 368 aa  179  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.8 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.81 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  31.88 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  32.11 
 
 		 373 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.47 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.48 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  30 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  31.27 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  33.73 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  31.44 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  33.15 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.26 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  32.56 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.02 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  31.61 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.13 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  29.31 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  26.23 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  29.89 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  31.8 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  31.85 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.38 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  32.18 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  27.45 
 
 		 371 aa  160  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  27.3 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  30.34 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.95 
 
 		 377 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  26.87 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.79 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.61 
 
 		 380 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  30.87 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.09 
 
 		 359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  28.94 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  27.2 
 
 		 404 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  25.5 
 
 		 377 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  26.15 
 
 		 371 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  25.27 
 
 		 399 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.76 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.29 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  28.57 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  28.57 
 
 		 371 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.3 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  25.28 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  30.64 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  26.84 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  26.19 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  25.34 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  24.21 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  27.12 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  29.72 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.95 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.93 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  25.96 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  28.95 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  24.64 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  27.43 
 
 		 398 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  25.53 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0596  DNA replication and repair protein RecF  29.17 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  27.82 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  27.04 
 
 		 360 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00444  recombination protein F  26.27 
 
 		 357 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.14 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.2 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  25.9 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0053  DNA replication and repair protein RecF  25.84 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>