279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1934 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  70.59 
 
 		 170 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  69.41 
 
 		 186 aa  244  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  48.19 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.21 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  40.68 
 
 		 179 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  40.24 
 
 		 234 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  37.64 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  39.29 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  36.87 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  36.97 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  33.93 
 
 		 183 aa  91.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.67 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  35.81 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  32.28 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  30.92 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  31.4 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  31.4 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  31.4 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  29.71 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  31.08 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  27.43 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  32.12 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  28.77 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.41 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.59 
 
 		 210 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.43 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.95 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  26.95 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.61 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  30.53 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  29.66 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  24.84 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.22 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  25.18 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.07 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.71 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.75 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  27.86 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.86 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  34.68 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  34.68 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  27.86 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  28.68 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  32.46 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  26.83 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  31.97 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  24.36 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  34.19 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  25.83 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  27.91 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  27.22 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  27.22 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.9 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  27.22 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  27.22 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.22 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  27.22 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  30.95 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  27.87 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  31.15 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  27.22 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  29.91 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  27.7 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  29.45 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.57 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  29.38 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  27.45 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.43 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.61 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.88 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  32.2 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  26.79 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.66 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  30.17 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.61 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.04 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>