More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1281 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  65.96 
 
 		 775 aa  753    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  66.14 
 
 		 775 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  66.32 
 
 		 775 aa  759    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  66.14 
 
 		 775 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  64.79 
 
 		 1981 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  59.55 
 
 		 714 aa  801    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  65.96 
 
 		 775 aa  753    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  66.41 
 
 		 540 aa  713    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  89.81 
 
 		 725 aa  1161    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  61.38 
 
 		 724 aa  789    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 676 aa  1409    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  65.96 
 
 		 775 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  65.96 
 
 		 775 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  46.57 
 
 		 743 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  46.38 
 
 		 1057 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  45.74 
 
 		 794 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  44.73 
 
 		 858 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  44.73 
 
 		 872 aa  552  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  44.73 
 
 		 930 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  44.73 
 
 		 896 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  44.99 
 
 		 922 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  44.99 
 
 		 916 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  45.1 
 
 		 729 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  44.99 
 
 		 874 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  45.1 
 
 		 729 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  44.38 
 
 		 1048 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  43.79 
 
 		 730 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  41.15 
 
 		 646 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  41.15 
 
 		 643 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  38.55 
 
 		 645 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 		 734 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 		 734 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 		 734 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 		 731 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 		 734 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  46.64 
 
 		 843 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  46.53 
 
 		 845 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 		 734 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 		 734 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  39.3 
 
 		 731 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  45.6 
 
 		 845 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  39.72 
 
 		 774 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  39.69 
 
 		 748 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  41.11 
 
 		 907 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  42.5 
 
 		 785 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  40.49 
 
 		 757 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  38.44 
 
 		 734 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  39.23 
 
 		 756 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  41.29 
 
 		 572 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  40.29 
 
 		 778 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  38.91 
 
 		 788 aa  439  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  38.14 
 
 		 734 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  41.12 
 
 		 730 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  38.74 
 
 		 777 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  39.64 
 
 		 794 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  40.44 
 
 		 755 aa  432  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  43.8 
 
 		 826 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  38.15 
 
 		 796 aa  422  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  39.26 
 
 		 741 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  38.77 
 
 		 741 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  39.61 
 
 		 792 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  40.21 
 
 		 771 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  39.63 
 
 		 822 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  40.77 
 
 		 780 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  37.3 
 
 		 741 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  42.51 
 
 		 1284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  41.14 
 
 		 841 aa  405  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  41.14 
 
 		 841 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  40.96 
 
 		 838 aa  405  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  41.14 
 
 		 841 aa  405  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  40.77 
 
 		 1048 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  38.83 
 
 		 689 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  37.88 
 
 		 689 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  38.57 
 
 		 712 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  42.51 
 
 		 1284 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  40.68 
 
 		 862 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  39.34 
 
 		 769 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  40.15 
 
 		 901 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  38.22 
 
 		 687 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  40.49 
 
 		 862 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  38.81 
 
 		 886 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  36.41 
 
 		 683 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  38.78 
 
 		 975 aa  364  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  35.07 
 
 		 735 aa  363  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  38.53 
 
 		 885 aa  359  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  38.53 
 
 		 918 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  35.26 
 
 		 683 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  36.42 
 
 		 767 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  38.17 
 
 		 920 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  36.42 
 
 		 767 aa  355  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  38.35 
 
 		 837 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  38.49 
 
 		 889 aa  352  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  35.13 
 
 		 661 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  36.46 
 
 		 703 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  35.88 
 
 		 618 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  34.96 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  34.96 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  35.29 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  34.96 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.78 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>