More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1211 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  94.9 
 
 		 295 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  71.86 
 
 		 296 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  60.41 
 
 		 294 aa  357  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 		 305 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 294 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 294 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  59.66 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  59.66 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  59.66 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  58.42 
 
 		 293 aa  328  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  56.4 
 
 		 299 aa  318  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  54.17 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  52.08 
 
 		 302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 291 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  44.83 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  45.8 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 301 aa  234  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  43.9 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 304 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  40.07 
 
 		 289 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  37.59 
 
 		 290 aa  225  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  39.36 
 
 		 289 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1480  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 295 aa  221  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  44.29 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  38.65 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  38.97 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  39.79 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.35 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  40.42 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 298 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 289 aa  215  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  37.59 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  38.7 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  39.72 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1652  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 302 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03330  putative transcriptional regulator  37.15 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  35.52 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>