More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1870 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
657 aa  1337    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  93.91 
 
 
657 aa  1261    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  80.21 
 
 
663 aa  1049    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
652 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.06 
 
 
652 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 
708 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
1297 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 
1559 aa  353  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
689 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
696 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
1331 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 
1002 aa  332  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
1808 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 
806 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
754 aa  309  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
606 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
1391 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 
930 aa  293  8e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
955 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
773 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
696 aa  289  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
1501 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
889 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1103  histidine kinase  42.89 
 
 
531 aa  286  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.458922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
1965 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  34.94 
 
 
678 aa  281  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
1085 aa  276  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
1478 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 
1419 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3575  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 
735 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
653 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
1330 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
1223 aa  270  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
934 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1235  histidine kinase  40.53 
 
 
573 aa  269  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
745 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
720 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
716 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  39.49 
 
 
725 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 
882 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
1068 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
662 aa  254  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  30.47 
 
 
1015 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.61 
 
 
1399 aa  252  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
865 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
697 aa  252  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
701 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
1557 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 
1287 aa  248  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
1431 aa  247  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
796 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
678 aa  244  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
631 aa  243  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
1548 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
816 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  35.8 
 
 
676 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
530 aa  241  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.27 
 
 
1759 aa  239  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1406 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
866 aa  239  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.55 
 
 
1214 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.95 
 
 
1220 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
628 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.63 
 
 
1407 aa  237  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
761 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
835 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
660 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
761 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1184 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
519 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
796 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.16 
 
 
1535 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
1287 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  35.75 
 
 
1131 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
938 aa  226  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  33.8 
 
 
1222 aa  225  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 
585 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 
667 aa  224  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 
760 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  36.3 
 
 
742 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
765 aa  221  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
660 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
663 aa  220  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
776 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
869 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
844 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
844 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
776 aa  217  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
526 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.78 
 
 
1371 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
647 aa  216  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
1084 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
623 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
803 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
641 aa  214  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
539 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  35.52 
 
 
547 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.31 
 
 
1380 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>