152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7312 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  65.53 
 
 
590 aa  746    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  66.04 
 
 
590 aa  755    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  77.16 
 
 
593 aa  912    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  73.3 
 
 
585 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  65.76 
 
 
586 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  73.94 
 
 
578 aa  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  80.33 
 
 
594 aa  890    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  76.26 
 
 
584 aa  869    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  79.25 
 
 
584 aa  884    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  62.07 
 
 
588 aa  742    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  72.07 
 
 
586 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
595 aa  1210    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  73.3 
 
 
585 aa  820    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  73.48 
 
 
568 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  72.84 
 
 
561 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  65.93 
 
 
586 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  73.98 
 
 
584 aa  828    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  75.28 
 
 
294 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  41.76 
 
 
578 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  37.85 
 
 
580 aa  375  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  40.74 
 
 
563 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  39.89 
 
 
582 aa  352  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  38.96 
 
 
592 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.01 
 
 
562 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  36.83 
 
 
562 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  36.84 
 
 
562 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.84 
 
 
562 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  36.83 
 
 
562 aa  349  9e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.41 
 
 
581 aa  343  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.64 
 
 
563 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  37.31 
 
 
581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.75 
 
 
581 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  36.82 
 
 
564 aa  333  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  37.58 
 
 
574 aa  332  9e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  37.13 
 
 
570 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  37.77 
 
 
572 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.25 
 
 
585 aa  306  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  33.91 
 
 
574 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.91 
 
 
568 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.39 
 
 
570 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  32.49 
 
 
550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  30.27 
 
 
556 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.68 
 
 
587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  27 
 
 
590 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  26.63 
 
 
590 aa  217  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  26.93 
 
 
566 aa  206  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  29.76 
 
 
565 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  29.55 
 
 
562 aa  203  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.42 
 
 
549 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.31 
 
 
557 aa  200  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.52 
 
 
560 aa  199  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  30.43 
 
 
562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  30.43 
 
 
562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.17 
 
 
554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.84 
 
 
566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.51 
 
 
554 aa  198  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.94 
 
 
593 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  30.05 
 
 
569 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  78.81 
 
 
121 aa  193  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.26 
 
 
585 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.71 
 
 
558 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  27.14 
 
 
539 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  29.56 
 
 
570 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0153  outer membrane hemolysin activator protein  72.17 
 
 
118 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.69 
 
 
568 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.72 
 
 
573 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  30.59 
 
 
570 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  28.8 
 
 
558 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  29.21 
 
 
554 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  28.8 
 
 
558 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  26.24 
 
 
562 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1986  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  66.37 
 
 
166 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  28.72 
 
 
554 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  31.3 
 
 
520 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  31.3 
 
 
551 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  31.3 
 
 
554 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.47 
 
 
560 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  28.44 
 
 
565 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  28.21 
 
 
582 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  27.63 
 
 
575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.03 
 
 
565 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  27.97 
 
 
602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  25.45 
 
 
558 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.48 
 
 
580 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.25 
 
 
610 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.09 
 
 
591 aa  131  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.09 
 
 
592 aa  130  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.87 
 
 
591 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27 
 
 
597 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.18 
 
 
608 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.39 
 
 
553 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.12 
 
 
513 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.46 
 
 
591 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.39 
 
 
553 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  26.13 
 
 
583 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  41.86 
 
 
354 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  25.38 
 
 
547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  26.09 
 
 
583 aa  108  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.99 
 
 
575 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>