175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5982 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  100 
 
 
589 aa  1214    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  71.38 
 
 
586 aa  867    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  41.1 
 
 
597 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  40.93 
 
 
597 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  38.79 
 
 
589 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  38.76 
 
 
597 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  35.99 
 
 
611 aa  350  6e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  35.47 
 
 
610 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  35.63 
 
 
606 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.45 
 
 
590 aa  332  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  34.67 
 
 
606 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  34.19 
 
 
606 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  34.51 
 
 
606 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.21 
 
 
590 aa  324  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  35.69 
 
 
611 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  35.69 
 
 
611 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  35.69 
 
 
611 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  34.63 
 
 
605 aa  317  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  31.48 
 
 
609 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  35.53 
 
 
611 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  35.36 
 
 
611 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  35.36 
 
 
611 aa  312  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  35.35 
 
 
611 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  34.26 
 
 
612 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  34.26 
 
 
612 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  34.09 
 
 
612 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  34.09 
 
 
612 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  34.09 
 
 
612 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  33.39 
 
 
612 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.48 
 
 
612 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  33.44 
 
 
619 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  33.44 
 
 
619 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  33.05 
 
 
611 aa  296  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  33.77 
 
 
619 aa  294  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  33.33 
 
 
616 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  32.17 
 
 
610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.96 
 
 
630 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.36 
 
 
624 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.47 
 
 
623 aa  279  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  32.03 
 
 
628 aa  279  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  33.88 
 
 
630 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  32.95 
 
 
623 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  31.92 
 
 
623 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  31.76 
 
 
623 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  31.76 
 
 
623 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  31.76 
 
 
623 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  31.76 
 
 
623 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  31.76 
 
 
623 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  30.95 
 
 
620 aa  264  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  28.71 
 
 
607 aa  263  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  31.6 
 
 
623 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.8 
 
 
626 aa  263  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  32.54 
 
 
629 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  31.35 
 
 
626 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  32.22 
 
 
623 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  32.61 
 
 
593 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  31.06 
 
 
592 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.13 
 
 
629 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  29.65 
 
 
611 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  31.48 
 
 
629 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  33.06 
 
 
660 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  30.98 
 
 
626 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  30.71 
 
 
626 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  30.71 
 
 
626 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  30.71 
 
 
626 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  29.34 
 
 
595 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  30 
 
 
626 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  30 
 
 
626 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  30 
 
 
626 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  31.79 
 
 
629 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  31.79 
 
 
629 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  31.79 
 
 
629 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  31.15 
 
 
620 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  31.79 
 
 
629 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  31.79 
 
 
629 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  31.79 
 
 
629 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  31.79 
 
 
629 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  28.33 
 
 
582 aa  237  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  30.85 
 
 
629 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  31.01 
 
 
629 aa  236  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  28.5 
 
 
582 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  30.24 
 
 
626 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  29.11 
 
 
624 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  30.17 
 
 
625 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  31.8 
 
 
627 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.33 
 
 
647 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  29.53 
 
 
595 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  31.8 
 
 
616 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  31.8 
 
 
627 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  28.38 
 
 
646 aa  231  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  32.12 
 
 
587 aa  230  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  31.8 
 
 
616 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  31.8 
 
 
616 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  31.8 
 
 
616 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  31.63 
 
 
627 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  30.68 
 
 
590 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  30.45 
 
 
603 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  31.64 
 
 
633 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  31.48 
 
 
633 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  30.94 
 
 
639 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221701 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>