More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2054 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2054  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 133 aa  258  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 352 aa  95.9  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  46.73 
 
 		 617 aa  90.9  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  46.53 
 
 		 356 aa  88.6  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  37.6 
 
 		 582 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  38.94 
 
 		 706 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  42.27 
 
 		 334 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  42.7 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  45.35 
 
 		 750 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  46.88 
 
 		 376 aa  74.7  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  38.05 
 
 		 706 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  40.95 
 
 		 243 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  32.28 
 
 		 539 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  41.9 
 
 		 3560 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  42.71 
 
 		 927 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 1276 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 371 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 		 306 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  45.24 
 
 		 543 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  36.73 
 
 		 462 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  40.45 
 
 		 391 aa  70.5  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  42.68 
 
 		 280 aa  70.1  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  39.6 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  40.82 
 
 		 581 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  43.68 
 
 		 804 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.52 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.52 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.95 
 
 		 542 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 593 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 615 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  38.32 
 
 		 750 aa  67  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 392 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.91 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.86 
 
 		 818 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.95 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.96 
 
 		 784 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.05 
 
 		 1022 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  34.74 
 
 		 560 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 1827 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.96 
 
 		 1056 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 275 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 3035 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 404 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 		 687 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  36.9 
 
 		 715 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  42.17 
 
 		 605 aa  63.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 458 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 732 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01941  Tfp pilus assembly protein PilF  29.66 
 
 		 270 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  40.48 
 
 		 306 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  37 
 
 		 515 aa  63.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.89 
 
 		 397 aa  63.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 		 1192 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 		 219 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.8 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 547 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 499 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.78 
 
 		 1056 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.8 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.24 
 
 		 988 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2435  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.61 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  33.59 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  40.59 
 
 		 602 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  33.03 
 
 		 635 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06840  phosphoprotein phosphatase, putative  29.25 
 
 		 586 aa  61.6  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.66618  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 363 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 556 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 292 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 		 4489 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 649 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 878 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.63 
 
 		 707 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 291 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  34.62 
 
 		 269 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 523 aa  60.1  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 		 266 aa  60.1  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 573 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  35.35 
 
 		 1240 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 738 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>