More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0485 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  87.79 
 
 
516 aa  904  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  87.21 
 
 
516 aa  903  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  87.79 
 
 
516 aa  904  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  88.57 
 
 
516 aa  904  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.51893e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  87.98 
 
 
516 aa  906  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.0169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  87.79 
 
 
516 aa  904  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 
516 aa  1022  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.02789e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  88.95 
 
 
516 aa  912  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.5754e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  87.98 
 
 
516 aa  906  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  88.54 
 
 
532 aa  906  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  88.95 
 
 
516 aa  910  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.13352e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  57.11 
 
 
505 aa  589  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  55.53 
 
 
505 aa  578  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  55.53 
 
 
505 aa  578  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  55.53 
 
 
505 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  55.93 
 
 
505 aa  579  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  56.6 
 
 
504 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  55.34 
 
 
505 aa  575  1e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  55.34 
 
 
505 aa  575  1e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  55.56 
 
 
504 aa  575  1e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  55.34 
 
 
505 aa  577  1e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  56.4 
 
 
504 aa  577  1e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83656e-05 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  52.68 
 
 
503 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  53.4 
 
 
498 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  47.49 
 
 
523 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  46.56 
 
 
546 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  44.55 
 
 
508 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  43.31 
 
 
506 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  44.55 
 
 
548 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  44.55 
 
 
548 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  2.12445e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  46.59 
 
 
490 aa  416  1e-115  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  44.97 
 
 
659 aa  416  1e-115  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  44.75 
 
 
659 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  44.44 
 
 
544 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  45.17 
 
 
520 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  45.17 
 
 
520 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  43.03 
 
 
577 aa  408  1e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  42.44 
 
 
551 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  42.71 
 
 
531 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  43.95 
 
 
526 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  45.53 
 
 
525 aa  405  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  41.39 
 
 
600 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  43.65 
 
 
530 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  42.13 
 
 
657 aa  400  1e-110  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  42.48 
 
 
497 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  38.06 
 
 
573 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  39.31 
 
 
585 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  43.47 
 
 
661 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  43.84 
 
 
550 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  38.13 
 
 
583 aa  389  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  41.77 
 
 
637 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  40.75 
 
 
573 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  43.8 
 
 
542 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  1.08541e-06 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  37.86 
 
 
610 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  45.01 
 
 
525 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  41.97 
 
 
606 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  43.31 
 
 
533 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  37.96 
 
 
582 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  41.77 
 
 
524 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  37.96 
 
 
582 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  43.23 
 
 
545 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  43.04 
 
 
682 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1122  transporter, BCCT family protein  47.76 
 
 
515 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  37.6 
 
 
574 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  37.96 
 
 
582 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  43.25 
 
 
661 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  43.16 
 
 
531 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  39.38 
 
 
611 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  38.89 
 
 
494 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  39.17 
 
 
685 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  39.18 
 
 
580 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  43.4 
 
 
660 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  39.38 
 
 
602 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  43 
 
 
673 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  42.54 
 
 
682 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  41.3 
 
 
580 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  39.58 
 
 
603 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  43.06 
 
 
658 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  37.74 
 
 
592 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  41.7 
 
 
656 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  41.01 
 
 
637 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  38.02 
 
 
667 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  42.2 
 
 
514 aa  372  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  43.25 
 
 
658 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  43.25 
 
 
658 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  36.54 
 
 
573 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  44.49 
 
 
687 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  43.25 
 
 
658 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  42.65 
 
 
606 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  39.64 
 
 
538 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  42.66 
 
 
661 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  41.45 
 
 
583 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  42.66 
 
 
660 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  37.07 
 
 
582 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  44.47 
 
 
664 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  43.65 
 
 
668 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  40.38 
 
 
530 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  43.06 
 
 
658 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  39.8 
 
 
646 aa  364  2e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  41.87 
 
 
658 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>