More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1746 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  93.75 
 
 
384 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
384 aa  764    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  94.53 
 
 
384 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  80.75 
 
 
378 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  74.6 
 
 
381 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  73.18 
 
 
384 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  72.85 
 
 
388 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  75.86 
 
 
382 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  72.25 
 
 
387 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  70.56 
 
 
380 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  63.54 
 
 
374 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  61.11 
 
 
378 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  56.5 
 
 
379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  56.12 
 
 
376 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  57.49 
 
 
378 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  51.6 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  53.93 
 
 
390 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  53.16 
 
 
382 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  49.47 
 
 
378 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  51.73 
 
 
371 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  51.07 
 
 
385 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  49.6 
 
 
385 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  50 
 
 
368 aa  354  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  48.66 
 
 
390 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  47.86 
 
 
377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  50.27 
 
 
390 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  48.92 
 
 
390 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  48.13 
 
 
377 aa  348  9e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  45.31 
 
 
378 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  47.11 
 
 
691 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  44.5 
 
 
373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  44.77 
 
 
373 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  44.77 
 
 
373 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  44.5 
 
 
373 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  44.5 
 
 
373 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  44.5 
 
 
373 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  44.24 
 
 
373 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  44.24 
 
 
373 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  43.97 
 
 
373 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  37.2 
 
 
378 aa  292  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  37.2 
 
 
378 aa  291  9e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  43.49 
 
 
381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.41 
 
 
365 aa  288  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  43.2 
 
 
366 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  40 
 
 
369 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  40.53 
 
 
367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  42.63 
 
 
375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  42.55 
 
 
366 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  43.2 
 
 
366 aa  279  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 
371 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  40.72 
 
 
382 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  40.43 
 
 
369 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  44.27 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  39.35 
 
 
369 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  40.05 
 
 
380 aa  252  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  36.84 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  35.7 
 
 
380 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  32.8 
 
 
376 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
369 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  37 
 
 
369 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  34.14 
 
 
373 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 
405 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  32.98 
 
 
377 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  34.93 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 
376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 
377 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 
368 aa  195  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 
366 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  33.07 
 
 
376 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 
376 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 
373 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 
375 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  32.54 
 
 
370 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 
373 aa  193  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
369 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
369 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 
376 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
368 aa  190  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  32.35 
 
 
378 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  33.69 
 
 
377 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  32.97 
 
 
376 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  33.86 
 
 
387 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  31.33 
 
 
379 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  31.1 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  29.19 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  35.16 
 
 
380 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 
375 aa  182  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  33.68 
 
 
375 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 
375 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
377 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  28 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  32.26 
 
 
371 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 
371 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  31.99 
 
 
381 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 
377 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 
378 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>