More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5642 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  100 
 
 
403 aa  827    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  30.51 
 
 
405 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  29.68 
 
 
403 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  31.6 
 
 
419 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  30.71 
 
 
420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  30.02 
 
 
432 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  31.46 
 
 
419 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  30.66 
 
 
418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  30.29 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  30.3 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  30.79 
 
 
439 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  30.22 
 
 
422 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.93 
 
 
415 aa  143  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  28.33 
 
 
404 aa  142  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  27.85 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  30.56 
 
 
425 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  26.17 
 
 
427 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  26.37 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  25.12 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  29.24 
 
 
403 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  24.62 
 
 
410 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.64 
 
 
433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  25.86 
 
 
414 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  25.86 
 
 
409 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  27.27 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.35 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  27.13 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  25.62 
 
 
409 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.75 
 
 
410 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  26.05 
 
 
400 aa  106  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  25.23 
 
 
440 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  25.79 
 
 
402 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  26.11 
 
 
419 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  23.88 
 
 
434 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  24.49 
 
 
449 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  26.33 
 
 
644 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.86 
 
 
406 aa  99.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.67 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  22.89 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  26.13 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  26.18 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  25.53 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  25 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  25.53 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  25.56 
 
 
414 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  25.81 
 
 
437 aa  96.3  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  26.75 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  23.87 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  25.29 
 
 
446 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  25.85 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1410  Phage integrase  24.94 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  24.56 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  25.32 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.5 
 
 
414 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  25.39 
 
 
393 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  26.46 
 
 
402 aa  92.8  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  24.2 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  26.68 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  25.06 
 
 
416 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  26.08 
 
 
461 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  25.45 
 
 
408 aa  90.9  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  24.29 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  27.44 
 
 
515 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  25.35 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  24.62 
 
 
414 aa  90.1  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.7 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  24.71 
 
 
455 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  26.63 
 
 
394 aa  89.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  25.42 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  25.65 
 
 
418 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4139  integrase family protein  24.88 
 
 
642 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217214  hitchhiker  0.0000125149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  25.82 
 
 
402 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  23.97 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  25.47 
 
 
643 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  25.73 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  23.77 
 
 
418 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  24.04 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  25.75 
 
 
404 aa  87  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  23.06 
 
 
414 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  23.6 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  24.78 
 
 
433 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1213  phage integrase family protein  26.62 
 
 
411 aa  86.7  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550435  normal  0.724829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  24.88 
 
 
400 aa  86.7  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  25.82 
 
 
404 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  23.92 
 
 
415 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  25.06 
 
 
404 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  25.12 
 
 
601 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  24.39 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.52 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  23.54 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  23.82 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  25.18 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  25.69 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  22.14 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  25.62 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0519  phage integrase  23.25 
 
 
434 aa  84  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  28.3 
 
 
617 aa  84  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4176  hypothetical protein  36.8 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  25.36 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  24.62 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>