More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2703 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 423 aa  848    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  51.51 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  49.41 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.98 
 
 		 410 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.79 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  24.32 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 399 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 417 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  31.54 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.97 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  30.31 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.19 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  28.62 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  31.87 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  29.07 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.84 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  32.5 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  34.5 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  25.76 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  29.38 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.58 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  30.1 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.78 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  33.12 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.27 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  28.78 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.88 
 
 		 434 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 451 aa  67  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 457 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.85 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.44 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>