More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2589 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  95.74 
 
 		 235 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  92.61 
 
 		 235 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5872  Crp/FNR family transcriptional regulator  94.85 
 
 		 235 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142608  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  92.61 
 
 		 235 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  92.61 
 
 		 235 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  88.26 
 
 		 235 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  73.54 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  73.54 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  73.54 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  73.54 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  73.09 
 
 		 266 aa  328  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  73.54 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.26 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  57.47 
 
 		 228 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  56.56 
 
 		 228 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 227 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4353  CRP/FNR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 227 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2665  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0675619  normal  0.290328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.44 
 
 		 237 aa  207  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.36 
 
 		 243 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.36 
 
 		 243 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  51.14 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0775  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 260 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0243  cyclic nucleotide-binding  42.4 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0313  cyclic nucleotide-binding protein  39.72 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.49 
 
 		 239 aa  138  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.59 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  35 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3129  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.55 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  34.25 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3781  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.91 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4858  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.91 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.748285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  35.61 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.8 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.27 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.36 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0827  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0664388  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2580  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.87 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1058  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0976  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.31 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.83 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.83 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.41 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.09 
 
 		 228 aa  92  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.09 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3110  cyclic nucleotide-binding protein  29.77 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  31.46 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  31.46 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  31.46 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.11 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2515  cyclic nucleotide-binding  28.11 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  31.31 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.11 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  27.88 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.05 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.44 
 
 		 350 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4138  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.86 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.59 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4026  cyclic nucleotide-binding protein  30.86 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.52 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>