84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2473 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  345  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  98.88 
 
 		 178 aa  342  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  84.27 
 
 		 178 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  71.84 
 
 		 174 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  80.52 
 
 		 165 aa  224  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  77.21 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  77.21 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  77.21 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  77.21 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  77.21 
 
 		 172 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  77.21 
 
 		 172 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  67.42 
 
 		 172 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  52.78 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  50 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  46.99 
 
 		 331 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  46.99 
 
 		 331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  43.66 
 
 		 325 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  42.96 
 
 		 333 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  54.03 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  54.03 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  44.06 
 
 		 167 aa  98.2  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  42.45 
 
 		 318 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  41.14 
 
 		 336 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  40.76 
 
 		 345 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  47.37 
 
 		 175 aa  91.3  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  40.76 
 
 		 336 aa  91.3  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  39.49 
 
 		 336 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  39.49 
 
 		 336 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  39.49 
 
 		 336 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  39.44 
 
 		 372 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  39.49 
 
 		 329 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  40.82 
 
 		 320 aa  88.6  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  44.85 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  37.84 
 
 		 339 aa  85.1  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  36.43 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  32.69 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  37.25 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  35.77 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  37.06 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  37.06 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  34.03 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  37.09 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  39.72 
 
 		 342 aa  67.8  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  37.69 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  38.05 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  36.22 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  36.22 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  37.3 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  26.97 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  35 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  35.33 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  32.12 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  40.41 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  40.91 
 
 		 325 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  34.65 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  40.74 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  40.15 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  37.62 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  37.62 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  37.62 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  30.32 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0344  hypothetical protein  34.97 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  35.94 
 
 		 122 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  30.61 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  30.52 
 
 		 323 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  31.17 
 
 		 323 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  30.41 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  30.41 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  30.41 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  30.41 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  30.41 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  30.41 
 
 		 321 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  30.41 
 
 		 313 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  29.29 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  33.57 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  30.52 
 
 		 323 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  29.73 
 
 		 321 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  30.72 
 
 		 323 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  29.3 
 
 		 324 aa  45.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  28.42 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  30.97 
 
 		 337 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  27.14 
 
 		 323 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>