More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1748 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 
612 aa  654  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  65.51 
 
 
607 aa  808  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  63.98 
 
 
607 aa  794  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  62.05 
 
 
606 aa  766  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  56.09 
 
 
606 aa  687  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  5.61063e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  56.53 
 
 
614 aa  717  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1265  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 
608 aa  665  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.879722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  63.98 
 
 
607 aa  794  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  62.52 
 
 
602 aa  754  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  97.52 
 
 
608 aa  1200  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2993  GTP-binding protein TypA  69.62 
 
 
608 aa  868  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0818072  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 
608 aa  640  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.44002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  65.34 
 
 
603 aa  799  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  55.44 
 
 
599 aa  661  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  57.14 
 
 
607 aa  672  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  56.86 
 
 
605 aa  679  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  65.51 
 
 
607 aa  808  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  62.05 
 
 
606 aa  763  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02547  GTP-binding protein TypA  64.84 
 
 
609 aa  806  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.404241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  85.05 
 
 
606 aa  1050  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  91.74 
 
 
608 aa  1136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  65.51 
 
 
607 aa  808  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0573  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 
612 aa  649  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.179658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  94.88 
 
 
608 aa  1173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  56.51 
 
 
606 aa  677  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0487  GTP-binding protein TypA  64.68 
 
 
609 aa  805  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  96.69 
 
 
608 aa  1195  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1704  GTP-binding protein TypA  68.86 
 
 
606 aa  859  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5376e-06 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0552  GTP-binding elongation factor protein  64.68 
 
 
609 aa  802  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  57.4 
 
 
607 aa  674  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  96.36 
 
 
608 aa  1191  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  65.56 
 
 
603 aa  803  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  55.94 
 
 
607 aa  658  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  64.83 
 
 
609 aa  788  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  63.85 
 
 
607 aa  794  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  62.19 
 
 
605 aa  776  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  62.33 
 
 
606 aa  769  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 
608 aa  671  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  54.09 
 
 
615 aa  685  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  62.17 
 
 
615 aa  762  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.38787e-05  hitchhiker  1.36232e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  56.05 
 
 
613 aa  664  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 
614 aa  659  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.55128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  62.54 
 
 
606 aa  773  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  58.12 
 
 
607 aa  696  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  57.93 
 
 
608 aa  679  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  54.09 
 
 
615 aa  685  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  57.64 
 
 
608 aa  688  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  54.95 
 
 
610 aa  651  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  57.83 
 
 
599 aa  697  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.75691e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  65.78 
 
 
609 aa  803  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  65.61 
 
 
609 aa  798  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  56.77 
 
 
608 aa  675  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  64.52 
 
 
607 aa  793  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  1.10369e-05 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  56.76 
 
 
600 aa  687  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  65.51 
 
 
607 aa  808  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  65.51 
 
 
607 aa  808  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  64.29 
 
 
609 aa  796  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 
627 aa  661  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  62.85 
 
 
602 aa  760  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  56.83 
 
 
609 aa  669  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  55.45 
 
 
615 aa  657  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  56.59 
 
 
600 aa  682  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  57.14 
 
 
602 aa  690  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  63.98 
 
 
607 aa  794  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  56.07 
 
 
602 aa  682  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 
616 aa  651  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  55.87 
 
 
614 aa  712  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  61.26 
 
 
606 aa  756  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  57.36 
 
 
596 aa  660  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  57.55 
 
 
601 aa  697  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.65728e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4219  GTP-binding protein TypA  64.18 
 
 
607 aa  793  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  65.18 
 
 
607 aa  810  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  65.51 
 
 
607 aa  808  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  65.35 
 
 
607 aa  813  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  85.22 
 
 
606 aa  1052  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4031  GTP-binding protein TypA  54.99 
 
 
606 aa  646  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  56.47 
 
 
613 aa  699  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2751  GTP-binding protein TypA  70.18 
 
 
611 aa  879  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  60.93 
 
 
606 aa  759  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  56.59 
 
 
602 aa  686  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 
616 aa  664  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1250  GTP-binding protein TypA  69.46 
 
 
609 aa  872  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0809475  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  56.07 
 
 
621 aa  664  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  64.96 
 
 
605 aa  823  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  53.73 
 
 
604 aa  640  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  57.26 
 
 
597 aa  668  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  55.44 
 
 
595 aa  635  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 
611 aa  667  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  56.11 
 
 
595 aa  647  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  64.63 
 
 
605 aa  823  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  55.79 
 
 
603 aa  702  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  54.97 
 
 
604 aa  682  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 
599 aa  660  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 
608 aa  638  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  64.95 
 
 
609 aa  799  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4267  GTP-binding protein TypA  54.77 
 
 
615 aa  651  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0798314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0383  GTP-binding protein TypA  63.25 
 
 
613 aa  776  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4502  GTP-binding protein TypA  63.85 
 
 
607 aa  794  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  57.24 
 
 
614 aa  703  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 
608 aa  676  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>