More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1342 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  53.3 
 
 		 607 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  53.3 
 
 		 607 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  55.57 
 
 		 600 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 598 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  52.23 
 
 		 606 aa  669    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  55.2 
 
 		 598 aa  668    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  64.85 
 
 		 615 aa  828    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 		 606 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  65.41 
 
 		 614 aa  857    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 605 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  66.72 
 
 		 614 aa  870    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  70.07 
 
 		 613 aa  889    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  53.3 
 
 		 607 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  51.08 
 
 		 603 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 606 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  65.41 
 
 		 614 aa  857    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  65.41 
 
 		 614 aa  857    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  65.57 
 
 		 614 aa  858    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  50.83 
 
 		 608 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  50.83 
 
 		 608 aa  640    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  52.05 
 
 		 606 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  51.65 
 
 		 607 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  51.07 
 
 		 609 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  55.37 
 
 		 598 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 608 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 603 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  53.48 
 
 		 610 aa  676    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  53.31 
 
 		 598 aa  659    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.94 
 
 		 596 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 609 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  52.55 
 
 		 606 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  50.91 
 
 		 602 aa  648    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 608 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  64.52 
 
 		 615 aa  827    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 		 600 aa  690    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  74.02 
 
 		 614 aa  950    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  56.08 
 
 		 602 aa  690    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 598 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 607 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  65.41 
 
 		 614 aa  857    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  53.3 
 
 		 607 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  53.31 
 
 		 598 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 		 597 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 603 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 609 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  51.07 
 
 		 608 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  53.3 
 
 		 607 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  50.16 
 
 		 615 aa  639    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 607 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  53.57 
 
 		 600 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  53.61 
 
 		 596 aa  650    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  50.66 
 
 		 600 aa  640    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  51.65 
 
 		 607 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 602 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0552  GTP-binding elongation factor protein  50.33 
 
 		 609 aa  637    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51.9 
 
 		 608 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 603 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  51.15 
 
 		 608 aa  641    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  51.74 
 
 		 603 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  65.57 
 
 		 614 aa  858    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  53.52 
 
 		 599 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 		 607 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  0.0000110369 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 603 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 		 614 aa  673    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  53.31 
 
 		 598 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 608 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 		 607 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  51.4 
 
 		 602 aa  657    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  50.74 
 
 		 610 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  50.74 
 
 		 610 aa  641    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  50.33 
 
 		 600 aa  639    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  54.51 
 
 		 596 aa  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 603 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 603 aa  650    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 602 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 		 603 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 		 608 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  51.16 
 
 		 605 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  69.14 
 
 		 613 aa  880    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0807  stress response membrane GTPase  78.02 
 
 		 611 aa  992    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0319085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  69.24 
 
 		 618 aa  895    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1342  stress response membrane GTPase  100 
 
 		 613 aa  1250    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0910775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  69.46 
 
 		 615 aa  887    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  51.16 
 
 		 604 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 608 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 603 aa  648    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  64.52 
 
 		 615 aa  827    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 		 603 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  50.91 
 
 		 602 aa  641    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  51.32 
 
 		 605 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  51.32 
 
 		 608 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 609 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>