48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2669 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  100 
 
 
242 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  100 
 
 
242 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  100 
 
 
242 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  99.59 
 
 
242 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  99.59 
 
 
242 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  99.17 
 
 
242 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  94.21 
 
 
242 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  100 
 
 
203 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  71.9 
 
 
231 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  73.14 
 
 
229 aa  339  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  71.9 
 
 
234 aa  339  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  78.14 
 
 
222 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  73.87 
 
 
224 aa  331  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  73.55 
 
 
232 aa  320  9e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  77.67 
 
 
222 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  64.88 
 
 
228 aa  314  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  62.81 
 
 
234 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85542e-07 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  69.15 
 
 
201 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  34.83 
 
 
226 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  38.99 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  35.76 
 
 
240 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  36.99 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  31.58 
 
 
230 aa  82  7e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  28.74 
 
 
215 aa  66.6  3e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  32.37 
 
 
233 aa  63.9  2e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  32 
 
 
213 aa  63.5  3e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  28.08 
 
 
232 aa  62  8e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33509e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  26.49 
 
 
212 aa  61.2  1e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  31.54 
 
 
202 aa  59.3  5e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  31.67 
 
 
226 aa  56.6  3e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  33.1 
 
 
282 aa  55.8  5e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  32.84 
 
 
227 aa  54.3  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  32.84 
 
 
253 aa  53.5  3e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  38.6 
 
 
235 aa  52.8  5e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  27.65 
 
 
191 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  30.58 
 
 
225 aa  50.4  2e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  23.32 
 
 
291 aa  49.3  6e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  30.51 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  48.21 
 
 
184 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  37.1 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  46.15 
 
 
223 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  40 
 
 
206 aa  45.8  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  28.69 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  34.15 
 
 
156 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.84 
 
 
146 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  31.67 
 
 
161 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  36 
 
 
161 aa  42  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  26.36 
 
 
251 aa  42  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>