More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0431 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0431  thymidylate kinase  100 
 
 
212 aa  430  1e-120  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.19831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  60.66 
 
 
212 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  60.66 
 
 
212 aa  269  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  60.66 
 
 
212 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1911  thymidylate kinase  59.24 
 
 
212 aa  262  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250893  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  59.81 
 
 
215 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  60.48 
 
 
219 aa  259  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  62.81 
 
 
219 aa  254  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1592  thymidylate kinase  58.85 
 
 
217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02903  thymidylate kinase  53.81 
 
 
210 aa  234  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003001  thymidylate kinase  53.33 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.390558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  55.92 
 
 
213 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  55.45 
 
 
213 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  55.45 
 
 
213 aa  228  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  55.45 
 
 
213 aa  228  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  55.45 
 
 
213 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  55.45 
 
 
213 aa  228  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  55.45 
 
 
213 aa  228  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  55.45 
 
 
213 aa  228  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  55.45 
 
 
213 aa  228  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  54.33 
 
 
210 aa  227  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  55.66 
 
 
213 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  55.66 
 
 
213 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  55.66 
 
 
213 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  55.66 
 
 
213 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  55.66 
 
 
213 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  54.59 
 
 
212 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  54.46 
 
 
213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  52.86 
 
 
210 aa  221  7e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  50.49 
 
 
209 aa  204  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  49.28 
 
 
212 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  49.75 
 
 
222 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  50 
 
 
215 aa  194  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1094  dTMP kinase  48.8 
 
 
223 aa  194  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  50.25 
 
 
209 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  46.63 
 
 
212 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  50.25 
 
 
209 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  49.26 
 
 
210 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  47.6 
 
 
215 aa  189  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2648  thymidylate kinase  50.25 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.106877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  50.76 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  49.75 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  49.75 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  50.76 
 
 
208 aa  188  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  50.76 
 
 
208 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  50.76 
 
 
208 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  50.76 
 
 
208 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  46.15 
 
 
212 aa  187  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  49.49 
 
 
208 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1982  thymidylate kinase  49.75 
 
 
210 aa  185  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.102848  hitchhiker  0.00478134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  48.73 
 
 
214 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  40.19 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  40.19 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.43 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.04 
 
 
211 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.29 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  44.02 
 
 
221 aa  145  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  41.75 
 
 
212 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  40 
 
 
200 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  38.16 
 
 
212 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  42.86 
 
 
207 aa  141  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  37.67 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  40.58 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  40 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  39.71 
 
 
210 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  43.23 
 
 
218 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  42.26 
 
 
203 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  42.29 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  40.78 
 
 
204 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  40.87 
 
 
206 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  41.54 
 
 
203 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  41.04 
 
 
206 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  41.04 
 
 
206 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.49 
 
 
206 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  41.06 
 
 
211 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  40.76 
 
 
225 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  38.68 
 
 
210 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  40.67 
 
 
206 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  41 
 
 
210 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  37.74 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  41.58 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  42 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  38.89 
 
 
210 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  40.28 
 
 
206 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  39.25 
 
 
205 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  40.57 
 
 
206 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  39.51 
 
 
222 aa  134  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  40.28 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  40.48 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  40.28 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  38.86 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  40.28 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  36.97 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  38.57 
 
 
901 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  33.33 
 
 
217 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  37.32 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  40.19 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  40.19 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  40.19 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  38.86 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>