More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_C0213 on replicon NC_011655
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  100 
 
 		 287 aa  594  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.15 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  40 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  40 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 145 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 1201 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  32 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 162 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  32.99 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  33.09 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.74 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 515 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2380  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  33.68 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  33.68 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  32.67 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  36.27 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  35.11 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.32 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.32 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.32 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.32 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  28.32 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 		 760 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.32 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  28.32 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  25.18 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 145 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 112 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  23.84 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  34.94 
 
 		 961 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 539 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 168 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 133 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  27.97 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.98 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 517 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  27.97 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 538 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>