92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A4125 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  384  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  96.76 
 
 
185 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  95.68 
 
 
185 aa  370  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  95.68 
 
 
185 aa  367  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  95.68 
 
 
185 aa  367  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  96.17 
 
 
185 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  96.17 
 
 
185 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  88.65 
 
 
185 aa  352  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  87.57 
 
 
185 aa  347  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  85.41 
 
 
185 aa  330  8e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  44.02 
 
 
193 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  46.43 
 
 
193 aa  154  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  29.94 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  27.89 
 
 
226 aa  80.9  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  36.79 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  25.71 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  34.17 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  38.2 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  24.29 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  25.27 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 
203 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  27.45 
 
 
253 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
218 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  26.89 
 
 
232 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  25.51 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  23.17 
 
 
215 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  26.51 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 
222 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  24.16 
 
 
210 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  21.51 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  23.66 
 
 
190 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  23.66 
 
 
190 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  20.25 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  22.58 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  20.11 
 
 
215 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  26.12 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  25.76 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  21.55 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  22.94 
 
 
196 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
190 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  21.21 
 
 
168 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  21.26 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  22.4 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  23.24 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  23.24 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  23.24 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  24.05 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  24.53 
 
 
206 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  19.28 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 
201 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  25.3 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  23.86 
 
 
252 aa  44.7  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  20.37 
 
 
168 aa  44.7  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  24.57 
 
 
202 aa  45.1  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  24.31 
 
 
212 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  25.44 
 
 
179 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  25.22 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
119 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  29.76 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  31.58 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  22.14 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  21.58 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  22.14 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  30.26 
 
 
255 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  37.88 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  34.21 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  22.14 
 
 
179 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  28.03 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  23.5 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  22.11 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  27.17 
 
 
165 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  30.26 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
114 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 
334 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  24.07 
 
 
242 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  24.73 
 
 
205 aa  41.2  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>