189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7520 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  100 
 
 
1177 aa  2323    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  38.08 
 
 
814 aa  317  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.76 
 
 
1081 aa  311  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  37.95 
 
 
1078 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  37.59 
 
 
1180 aa  304  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  31.14 
 
 
986 aa  301  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  31.74 
 
 
995 aa  297  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  37.62 
 
 
2407 aa  297  9e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  39.7 
 
 
882 aa  289  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  38.02 
 
 
1130 aa  278  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  35.99 
 
 
1019 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  34.09 
 
 
1053 aa  270  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  36.72 
 
 
1111 aa  265  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  35.89 
 
 
987 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  48.08 
 
 
653 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  44.24 
 
 
657 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40.48 
 
 
634 aa  251  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  39.3 
 
 
683 aa  250  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  47.72 
 
 
652 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.45 
 
 
1532 aa  248  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  48.08 
 
 
653 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  48.08 
 
 
653 aa  248  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  47.13 
 
 
652 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  40.58 
 
 
641 aa  244  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  39.56 
 
 
634 aa  244  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  42.82 
 
 
661 aa  241  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.41 
 
 
1011 aa  221  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  34.86 
 
 
907 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  42.52 
 
 
348 aa  194  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  35.32 
 
 
678 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  28.39 
 
 
1004 aa  150  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  28.25 
 
 
1033 aa  147  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.49 
 
 
1125 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  27.18 
 
 
1055 aa  127  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.25 
 
 
447 aa  122  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  27.18 
 
 
1038 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  28.64 
 
 
1782 aa  117  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  27.64 
 
 
1062 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  35.74 
 
 
423 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  26.01 
 
 
1001 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  25.57 
 
 
1001 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.39 
 
 
431 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  26.92 
 
 
983 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.69 
 
 
1134 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  35.32 
 
 
423 aa  109  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  35.32 
 
 
423 aa  109  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  28.85 
 
 
816 aa  108  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.86 
 
 
1285 aa  108  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.27 
 
 
425 aa  106  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.09 
 
 
1156 aa  106  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.62 
 
 
465 aa  105  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.21 
 
 
991 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  36.21 
 
 
1028 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  25.04 
 
 
1006 aa  101  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.83 
 
 
1179 aa  99.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.73 
 
 
1154 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  29.2 
 
 
909 aa  96.3  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.03 
 
 
1227 aa  96.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  26.62 
 
 
995 aa  95.1  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  26.82 
 
 
947 aa  94  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.7 
 
 
1029 aa  94  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  26.25 
 
 
1333 aa  93.2  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1826  outer membrane protein  41.22 
 
 
190 aa  92.8  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400541  normal  0.391918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  28.23 
 
 
959 aa  92.8  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.27 
 
 
906 aa  92.8  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  28.64 
 
 
965 aa  91.7  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.88 
 
 
378 aa  90.9  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  39.45 
 
 
1459 aa  90.9  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  32.34 
 
 
954 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  31.56 
 
 
974 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.86 
 
 
378 aa  89.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.82 
 
 
510 aa  89.7  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.84 
 
 
472 aa  89.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  26.98 
 
 
1119 aa  89  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  27.41 
 
 
942 aa  87.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  25.49 
 
 
650 aa  87  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.87 
 
 
926 aa  85.5  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.12 
 
 
1769 aa  84.7  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.85 
 
 
915 aa  84.7  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  28.55 
 
 
970 aa  84.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  24.31 
 
 
1056 aa  81.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  28.21 
 
 
998 aa  80.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  28.21 
 
 
949 aa  79.7  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.84 
 
 
919 aa  79.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  28.55 
 
 
2371 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  43.05 
 
 
1325 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  28.68 
 
 
2366 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  40.64 
 
 
1458 aa  79  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.31 
 
 
1489 aa  79  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  38.57 
 
 
1446 aa  77.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  26.96 
 
 
985 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  23.44 
 
 
4248 aa  76.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  30.58 
 
 
1012 aa  75.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.7 
 
 
470 aa  75.1  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.78 
 
 
913 aa  74.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.13 
 
 
910 aa  70.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  26.27 
 
 
2003 aa  68.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  41.61 
 
 
550 aa  68.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  25.94 
 
 
1011 aa  67.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  28.41 
 
 
4238 aa  67  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>