More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46930 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  100 
 
 
126 aa  255  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 
126 aa  177  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  65.87 
 
 
126 aa  171  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  45.61 
 
 
361 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  46.03 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  44.07 
 
 
120 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  45.38 
 
 
136 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
128 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  42.86 
 
 
128 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.44 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.17 
 
 
388 aa  97.1  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  45.9 
 
 
130 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.18 
 
 
393 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  45.3 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 
389 aa  87.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  43.09 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  43.44 
 
 
128 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  40.65 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  41.18 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  45.22 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  40.31 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  45.19 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  38.6 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  42.73 
 
 
323 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  41.27 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  43.22 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  41.35 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  43.55 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  37.82 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  38.18 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  38.4 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  37.9 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  37.72 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  37.27 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  36.8 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  40 
 
 
346 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  39.32 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  38.58 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  40.86 
 
 
99 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  40.86 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  46.24 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  37.29 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  46.15 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  35.94 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  37.82 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  35.29 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  47.44 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  42.5 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  38.14 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  41.03 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  37.01 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  36.13 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  36.97 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  39.53 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  45.35 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  40.34 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  39.83 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  37.19 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  42.35 
 
 
471 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2263  rhodanese-like domain protein  38.33 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  37.4 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  33.88 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  38.39 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  32.23 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  35.35 
 
 
479 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  44.87 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.91 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  41.05 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  38.27 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  38.6 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  38.3 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  34.58 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  44.57 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  39 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  37.35 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  37.74 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  43.59 
 
 
119 aa  67  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  33.93 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.93 
 
 
480 aa  67.4  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  39.33 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  38.94 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  31.62 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  45.57 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.78 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>