More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2263 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2263  rhodanese-like domain protein  100 
 
 		 125 aa  256  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  39.17 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  37.9 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  39.84 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  40.18 
 
 		 361 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  32.77 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  33.88 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  33.08 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  33.08 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  35.24 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.86 
 
 		 389 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  35.87 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.48 
 
 		 562 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  35.48 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  34.86 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.25 
 
 		 393 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  36.78 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35.85 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.04 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36.29 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  32.71 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.31 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.31 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  27.91 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  32.17 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  40.45 
 
 		 288 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  32.46 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.57 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  32.58 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.9 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.9 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  34 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  34.15 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  33.62 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  32.04 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  33.08 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.47 
 
 		 566 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.47 
 
 		 566 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  30.16 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.43 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  28.8 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  29.9 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  30 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.27 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  31.82 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  26.79 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  26.89 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  31.19 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  32.31 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1625  rhodanese domain-containing protein  26.79 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.535046  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 269 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  28.21 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1098  rhodanese-like domain-containing protein  28.28 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.50034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 220 aa  50.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.84 
 
 		 388 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  26.89 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  28.85 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30.3 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 290 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  28.43 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 		 480 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  26.45 
 
 		 354 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  25.49 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  30.39 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>