More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04010 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  100 
 
 
504 aa  1016    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  54.32 
 
 
496 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  55.23 
 
 
496 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.24 
 
 
509 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.09 
 
 
509 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  53.44 
 
 
509 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  55.97 
 
 
498 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  54.35 
 
 
499 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.61 
 
 
515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.82 
 
 
509 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  55.97 
 
 
494 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50.1 
 
 
604 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  49.8 
 
 
514 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.17 
 
 
552 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  48.95 
 
 
576 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  48.64 
 
 
593 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  48.95 
 
 
582 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  48.95 
 
 
582 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  48.95 
 
 
615 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  48.95 
 
 
594 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  49.37 
 
 
601 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  48.95 
 
 
585 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.97 
 
 
543 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.25 
 
 
515 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.23 
 
 
529 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  48.02 
 
 
525 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.5 
 
 
505 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.5 
 
 
505 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  40.71 
 
 
533 aa  326  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  41.88 
 
 
489 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.16 
 
 
509 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  38.8 
 
 
483 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.06 
 
 
509 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  40.71 
 
 
519 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.2 
 
 
474 aa  292  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.33 
 
 
514 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.85 
 
 
489 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.44 
 
 
480 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.7 
 
 
498 aa  237  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.21 
 
 
502 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.4 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  37.97 
 
 
475 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.55 
 
 
483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 
504 aa  233  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.93 
 
 
482 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.65 
 
 
499 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  33.04 
 
 
505 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.68 
 
 
493 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.75 
 
 
504 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  35.03 
 
 
492 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  34.85 
 
 
490 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.93 
 
 
491 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
502 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.41 
 
 
498 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1514  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.81 
 
 
483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 
498 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.18 
 
 
498 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 
498 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 
498 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 
514 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.54 
 
 
504 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 
498 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 
493 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 
514 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.01 
 
 
517 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.55 
 
 
498 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.55 
 
 
498 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.93 
 
 
517 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.09 
 
 
699 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.1 
 
 
498 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.26 
 
 
490 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.41 
 
 
498 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.81 
 
 
527 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0323  Fis family transcriptional regulator  37.06 
 
 
556 aa  207  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.362622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0561  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.93 
 
 
629 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  32.56 
 
 
502 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  32.18 
 
 
502 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.1 
 
 
515 aa  203  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.12 
 
 
702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.18 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  33.33 
 
 
484 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5190  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.91 
 
 
618 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175856  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5092  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.7 
 
 
616 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0523348  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3276  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.7 
 
 
616 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108062  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.84 
 
 
553 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1876  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.84 
 
 
553 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138949  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1827  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.67 
 
 
527 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0730  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.67 
 
 
527 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1916  Outer membrane protein  35.67 
 
 
527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19047  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1014  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.67 
 
 
527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998145  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0191  putative outer membrane protein  35.67 
 
 
527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5029  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.63 
 
 
606 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145963  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0815  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.67 
 
 
527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103865  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.44 
 
 
527 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.44 
 
 
527 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0685909  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4504  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.48 
 
 
605 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0463  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.79 
 
 
531 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.79 
 
 
531 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.805675  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0457  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.79 
 
 
531 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.555102  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0718  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.79 
 
 
531 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0239244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>