More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3902 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  71.65 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  69.53 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  69.12 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  64.89 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  62.99 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  66.38 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  60.47 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  60 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  57.48 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  59.84 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  68.81 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  58.65 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  60.29 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  60.34 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  59.83 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  58.47 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  56.67 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  59.09 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  57.66 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  57.41 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  57.39 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  47.62 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 144 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  51.2 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  49.18 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  51.59 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  52.14 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  48.51 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  47.2 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  43.09 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  44.26 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  46.22 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  40.77 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  41.22 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  46.15 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  44.04 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  45.65 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  41.75 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  37.96 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  41.75 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 305 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 304 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5508  helix-turn-helix domain-containing protein  32.8 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  36.08 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 322 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  38.61 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 513 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 309 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 291 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 293 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 277 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  34.65 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5551  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  42.74 
 
 		 285 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 295 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 265 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 294 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 255 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 292 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2162  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.637504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>