More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2135 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
565 aa  1115    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  52.81 
 
 
556 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 
568 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
571 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  43.64 
 
 
573 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  39.82 
 
 
572 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 
573 aa  382  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
567 aa  375  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  42.63 
 
 
591 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
535 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  42.78 
 
 
577 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.97 
 
 
566 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
566 aa  356  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
592 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
580 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 
579 aa  341  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
588 aa  341  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
566 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
566 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
566 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  39.75 
 
 
578 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  42.05 
 
 
536 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
544 aa  316  8e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
559 aa  310  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
568 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
575 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  37.68 
 
 
549 aa  299  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  39.05 
 
 
573 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
535 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
631 aa  283  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
568 aa  279  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
543 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
525 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
590 aa  232  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  31.66 
 
 
543 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  59.26 
 
 
392 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 
456 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 
381 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.23 
 
 
386 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  28.31 
 
 
635 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  31.72 
 
 
385 aa  137  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  45.86 
 
 
373 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  33.92 
 
 
401 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
372 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
409 aa  118  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
373 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  33.08 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  29.48 
 
 
851 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.92 
 
 
665 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  32.36 
 
 
484 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  30.06 
 
 
828 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 
535 aa  90.5  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
345 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.84 
 
 
603 aa  88.2  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
464 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  25.31 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.05 
 
 
604 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 
673 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  25.63 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.31 
 
 
725 aa  84.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.48 
 
 
602 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  33.65 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2567  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.48 
 
 
623 aa  83.6  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
546 aa  83.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.49 
 
 
593 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  28.73 
 
 
529 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.49 
 
 
593 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  26.13 
 
 
351 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.52 
 
 
380 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.69 
 
 
598 aa  82  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  30.61 
 
 
967 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27 
 
 
598 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27 
 
 
598 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27 
 
 
598 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27 
 
 
598 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27 
 
 
613 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  25.63 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  25.63 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  25.63 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  25.63 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  25.63 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
469 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2908  histidine kinase  25.7 
 
 
246 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108136  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  49.54 
 
 
795 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  25.13 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  25.13 
 
 
351 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2224  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.07 
 
 
589 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129909  normal  0.0788983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
730 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>