More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0003 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 
372 aa  716  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  95.43 
 
 
372 aa  660  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  98.39 
 
 
372 aa  706  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  80.38 
 
 
369 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  39.51 
 
 
364 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  38.96 
 
 
364 aa  253  4e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  34.6 
 
 
364 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  38.92 
 
 
365 aa  235  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  37.77 
 
 
370 aa  234  2e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  40.11 
 
 
365 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  39.43 
 
 
382 aa  220  4e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  35.34 
 
 
368 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.93 
 
 
386 aa  197  4e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.33 
 
 
365 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  31.38 
 
 
371 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  30.56 
 
 
370 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  30.56 
 
 
370 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  31.82 
 
 
373 aa  183  4e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  31.85 
 
 
374 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.29 
 
 
372 aa  182  9e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.68 
 
 
376 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.56 
 
 
373 aa  180  3e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  31.38 
 
 
375 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  31.38 
 
 
375 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  34.41 
 
 
363 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  31.38 
 
 
375 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  31.38 
 
 
375 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  31.12 
 
 
375 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  29.84 
 
 
362 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  31.12 
 
 
375 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  31.12 
 
 
375 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  31.12 
 
 
375 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  31.12 
 
 
375 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  31.12 
 
 
375 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  31.58 
 
 
365 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.1 
 
 
371 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  33.51 
 
 
372 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  33.51 
 
 
374 aa  175  1e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  31.64 
 
 
369 aa  174  2e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.48 
 
 
362 aa  174  2e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.15018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  30.67 
 
 
374 aa  170  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  31 
 
 
366 aa  170  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  31.94 
 
 
374 aa  169  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  27.52 
 
 
369 aa  167  3e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  33.98 
 
 
376 aa  165  1e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  1.32668e-05 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  32.89 
 
 
371 aa  165  1e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  38.34 
 
 
387 aa  165  1e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.32 
 
 
375 aa  163  4e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  32.22 
 
 
359 aa  162  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  36.49 
 
 
390 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  3.32989e-05  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.62 
 
 
360 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.67 
 
 
374 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  35.49 
 
 
357 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.73 
 
 
361 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.73 
 
 
361 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.55 
 
 
397 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.76 
 
 
370 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.48 
 
 
360 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  37.33 
 
 
390 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  35.54 
 
 
401 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  33.69 
 
 
401 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.7 
 
 
370 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  26.71 
 
 
358 aa  154  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  34.97 
 
 
349 aa  152  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  34.63 
 
 
386 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0053  DNA replication and repair protein RecF  34.92 
 
 
347 aa  152  9e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  38.76 
 
 
404 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  32.14 
 
 
414 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.73 
 
 
377 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  30.4 
 
 
373 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.75 
 
 
358 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  36.13 
 
 
385 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.42 
 
 
360 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  27.27 
 
 
371 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  32.35 
 
 
367 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0003  recombination protein F  31.82 
 
 
367 aa  148  1e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  32.09 
 
 
367 aa  148  1e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0003  recombination protein F  31.82 
 
 
367 aa  149  1e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.510695  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  35.34 
 
 
358 aa  149  1e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.3 
 
 
359 aa  149  1e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  35.33 
 
 
392 aa  148  1e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.43 
 
 
381 aa  149  1e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  32.09 
 
 
367 aa  148  2e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50595e-05 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  28.15 
 
 
365 aa  147  2e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  37.42 
 
 
387 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0003  recombination protein F  32.09 
 
 
367 aa  147  4e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153172  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.79 
 
 
380 aa  146  4e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  33.16 
 
 
390 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  31.64 
 
 
361 aa  146  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  30.19 
 
 
369 aa  145  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  34.17 
 
 
389 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  32.37 
 
 
367 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.82 
 
 
367 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.58 
 
 
354 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180653  normal  0.423581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  34.42 
 
 
402 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0003  recombination protein F  31.48 
 
 
369 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00030  recombination protein F  31.22 
 
 
369 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  31.28 
 
 
367 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  29.82 
 
 
360 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  33.33 
 
 
380 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>