More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2469 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 224 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  59.52 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  55.76 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  47.55 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 263 aa  104  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 243 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 257 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.36 
 
 		 266 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.36 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  33.5 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.91 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  35.11 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.25 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  29 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  26.82 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  31.71 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>