More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0659 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 361 aa  697    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  41.13 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.72 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.6 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  41.23 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  41.81 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  42.09 
 
 		 359 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.64 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.84 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.48 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  38.35 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  39.66 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.46 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  39.72 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  39.83 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.83 
 
 		 618 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.12 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  39.27 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.89 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  40.66 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.11 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  34.18 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.5 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.5 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.5 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  38.27 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  39 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  37.97 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  35.65 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  37.57 
 
 		 392 aa  152  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  41.16 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.03 
 
 		 362 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  34.85 
 
 		 401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  35.71 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  33.94 
 
 		 398 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.12 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  31.81 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.24 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.33 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  38.15 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  33.64 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.49 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.15 
 
 		 359 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.61 
 
 		 383 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  34.85 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  31.46 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  37.31 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  33.24 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  34.56 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  33.43 
 
 		 405 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  35.67 
 
 		 406 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  35.67 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  33.64 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  34.21 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  37.01 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  34.25 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  35.31 
 
 		 410 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  33.94 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2017  succinyldiaminopimelate transaminase  36.31 
 
 		 420 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  34.03 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  34.44 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  32.83 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  41.4 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  33.74 
 
 		 399 aa  135  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  33.84 
 
 		 404 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  33.84 
 
 		 404 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  27.95 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  34.06 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  34.44 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  36.01 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  32.74 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  29.67 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  32.23 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  33.63 
 
 		 407 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  30.56 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  34.33 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  35.13 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  34.46 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  34.18 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  34.46 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  34.46 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  34.46 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  34.46 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  31.33 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  30.06 
 
 		 412 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2504  succinyldiaminopimelate transaminase  35.45 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2068  succinyldiaminopimelate transaminase  35.45 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.854431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1565  succinyldiaminopimelate transaminase  35.45 
 
 		 415 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155441  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3244  succinyldiaminopimelate transaminase  35.45 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667849  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  35.45 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1494  aminotransferase  35.35 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0144  aminotransferase, class I and II  35.35 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.680923  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2448  succinyldiaminopimelate transaminase  34.85 
 
 		 410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.805274  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  30.48 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  36.83 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  34.2 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>