More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1656 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  100 
 
 
363 aa  697    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  95.59 
 
 
363 aa  627  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  95.87 
 
 
363 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  62 
 
 
365 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  32.53 
 
 
383 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.84 
 
 
380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  30.18 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  27.63 
 
 
384 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 
379 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  27.3 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.07 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  30.41 
 
 
380 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  29.84 
 
 
380 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  29.84 
 
 
380 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.89 
 
 
389 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  30.99 
 
 
380 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  26.9 
 
 
383 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  30.7 
 
 
380 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  29.53 
 
 
389 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  29.62 
 
 
381 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  30.55 
 
 
384 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  29.47 
 
 
457 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  28.25 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  28.93 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.4 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  28.9 
 
 
431 aa  97.1  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 
963 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.35 
 
 
432 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  30.58 
 
 
475 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.24 
 
 
386 aa  93.2  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  27.3 
 
 
392 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.09 
 
 
395 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.66 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 
411 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.07 
 
 
411 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
687 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  24.19 
 
 
417 aa  89.7  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  26.33 
 
 
386 aa  89.4  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  23.05 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.89 
 
 
395 aa  87  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.18 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.06 
 
 
415 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.19 
 
 
391 aa  85.9  9e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.64 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  27.99 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  27.46 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  28.95 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.55 
 
 
395 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  30.3 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.23 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  26.5 
 
 
455 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.67 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28 
 
 
395 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
774 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.64 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  28.2 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  28.05 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.97 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.99 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.7 
 
 
652 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  25.7 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  33.21 
 
 
901 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  30.34 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.62 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  28.62 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  26.78 
 
 
653 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.67 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.1 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.23 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.55 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.37 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  23.97 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
795 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  26.3 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.47 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.2 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.55 
 
 
395 aa  77  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  28.69 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  25.62 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  33.21 
 
 
1454 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  22.68 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  25.96 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  29.8 
 
 
484 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  28.1 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  28.26 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  26.15 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  27.85 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  32.12 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  29.91 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>