More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0684 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  99.27 
 
 
409 aa  810    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  99.27 
 
 
409 aa  810    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  100 
 
 
409 aa  816    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  79.71 
 
 
409 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  47.32 
 
 
412 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  42.62 
 
 
409 aa  330  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  39.8 
 
 
401 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  36.52 
 
 
403 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  36.56 
 
 
406 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  37.38 
 
 
405 aa  298  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  39.08 
 
 
405 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  42.12 
 
 
403 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  39.42 
 
 
407 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  39.42 
 
 
407 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  39.42 
 
 
407 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  39.42 
 
 
407 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  40.39 
 
 
403 aa  292  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  39.85 
 
 
407 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  37.38 
 
 
401 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0607  general secretion pathway protein F  40.89 
 
 
400 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000348524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0327  general secretion pathway protein F  42.61 
 
 
403 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  38.2 
 
 
406 aa  289  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  35.92 
 
 
405 aa  289  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  39.37 
 
 
407 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  39.76 
 
 
407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  36.8 
 
 
413 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  38.2 
 
 
407 aa  285  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.92 
 
 
405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  37.71 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  37.14 
 
 
405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  36.56 
 
 
407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  35.12 
 
 
404 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  38.12 
 
 
408 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  39.27 
 
 
404 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0593  general secretion pathway protein F  40.39 
 
 
400 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  36.45 
 
 
419 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  39.05 
 
 
402 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  35.37 
 
 
405 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  38.26 
 
 
410 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  39.81 
 
 
407 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  39.17 
 
 
407 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  39.17 
 
 
407 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  38.93 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  35.94 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  40.44 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  35.66 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  35.66 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  35.91 
 
 
417 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  36.89 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  39.07 
 
 
408 aa  274  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  37.97 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  38.18 
 
 
406 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  38.69 
 
 
407 aa  272  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  37.07 
 
 
405 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  38.14 
 
 
403 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 
408 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  39 
 
 
417 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  36.67 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  36.23 
 
 
406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  37.16 
 
 
405 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  36.45 
 
 
422 aa  268  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  38.29 
 
 
409 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  34.63 
 
 
404 aa  266  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  36.39 
 
 
406 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  36.05 
 
 
404 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  36.54 
 
 
417 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  36.05 
 
 
404 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  39.71 
 
 
408 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  34.81 
 
 
404 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2894  general secretion pathway protein F  35.28 
 
 
410 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  36.92 
 
 
406 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  37.41 
 
 
405 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  39.61 
 
 
407 aa  259  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  36.32 
 
 
408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  35.89 
 
 
407 aa  259  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  36.3 
 
 
407 aa  258  9e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  37.93 
 
 
403 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  38.88 
 
 
403 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  35.19 
 
 
404 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  36.92 
 
 
405 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  35.57 
 
 
396 aa  256  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  38.78 
 
 
408 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  36.92 
 
 
405 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  40 
 
 
410 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  38.42 
 
 
404 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  38.48 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  36.39 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  35.45 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  39.27 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  38.24 
 
 
405 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  37.5 
 
 
407 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  35.47 
 
 
403 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  38.24 
 
 
405 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  38.18 
 
 
404 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  38.24 
 
 
405 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  35.07 
 
 
419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  38.11 
 
 
407 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  37.41 
 
 
405 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  37.71 
 
 
405 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  37.47 
 
 
407 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>