More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2072 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 392 aa  778    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  62.04 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  29.9 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  31.97 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 377 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 496 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 446 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 383 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 385 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 500 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  28.4 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.17 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 376 aa  126  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 444 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.93 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  30.12 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  30.12 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  29.61 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  30.12 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  29.95 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.47 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  28.98 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 441 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 441 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 441 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.89 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.32 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  27.32 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  28.01 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5746  sarcosine oxidase beta subunit  25.86 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.267033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.74 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  31.61 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.84 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.73 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 819 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.89 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  25.46 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4713  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  25 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1949  sarcosine oxidase, beta subunit  28.99 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>