More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1226 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1226  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0600156  unclonable  0.00000985108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  48.83 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  47 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  48.13 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  48.6 
 
 		 209 aa  188  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  47.17 
 
 		 211 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 205 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  48.39 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  46.54 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  46.54 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  46.73 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  46.85 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  48.36 
 
 		 205 aa  185  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  48.36 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  47.2 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  46.36 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  44.91 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  47.47 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  46.05 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  45.37 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  46.48 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  44.95 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  44.95 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  46.58 
 
 		 210 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  48.37 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  45.62 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  45.21 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  45.13 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  44.19 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  47.2 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  49.53 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  45.33 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  45.33 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  46.76 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  44.86 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 205 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  44.81 
 
 		 212 aa  178  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  45.66 
 
 		 210 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1851  50S ribosomal protein L3  43.67 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  46.73 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  42.99 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  44.7 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  46.73 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  45.66 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  46.26 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  42.86 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  44.7 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  45.62 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1975  50S ribosomal protein L3  42.48 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  42.48 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1890  50S ribosomal protein L3  42.48 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  42.86 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  44.24 
 
 		 211 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  46.15 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  43.78 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  45.16 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1988  50S ribosomal protein L3  42.04 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  45.21 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  43.66 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  43.4 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  45.66 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  43.4 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  44.24 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  43.66 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  42.4 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  43.87 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  44.39 
 
 		 209 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  44.19 
 
 		 205 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  41.2 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  44.81 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  44.81 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  42.06 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  40.55 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  42.38 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  44.6 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  41.94 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  40.27 
 
 		 213 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  45.07 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>