More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2064 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2296  50S ribosomal protein L3  80.86 
 
 		 209 aa  353  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600066  hitchhiker  0.00331239 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  73.68 
 
 		 209 aa  321  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  72.73 
 
 		 209 aa  320  8e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  72.73 
 
 		 209 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  70.33 
 
 		 209 aa  318  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  67.94 
 
 		 209 aa  303  9.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  56.1 
 
 		 205 aa  242  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  55.67 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 206 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  56.1 
 
 		 205 aa  231  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  52.2 
 
 		 205 aa  228  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 220 aa  225  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 205 aa  214  5e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 205 aa  211  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 210 aa  205  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  45.63 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50.5 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  48.29 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  46.08 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  45.63 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  48.45 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  47.03 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000449005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  46.04 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000128128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  47.5 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  49.5 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  49.5 
 
 		 206 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  47.29 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  45.63 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  47.26 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0858  ribosomal protein L3  46.04 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.451508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  45.32 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 209 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  45.1 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  45.1 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1854  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000292484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  44.83 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  43.63 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  44.39 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  47.69 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  48.24 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  45 
 
 		 217 aa  184  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  43.3 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0337  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  44.85 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  46.94 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  45.08 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3019  50S ribosomal protein L3  43.07 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000216849  hitchhiker  0.0059333 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  46.04 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  45.6 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  46.43 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  44.02 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  45.6 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  45.08 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  45.08 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  45.08 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  46.43 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  44.56 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2759  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000332087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0327  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000900525  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0348  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000116037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  46 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  46.31 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  46.04 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>